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聊聊p53mRNA

(2019-03-30 10:14:23)
标签:

p53

mrna

rna

核酸研究

基因表达

分类: 上海艾博思生物科技有限公司
聊聊p53 mRNA
聊聊p53mRNA


本文从p53 mRNA角度介绍它的功能和调控作用的多样性。

应激反应调控p53 mRNA选择性翻译
聊聊p53mRNA

图1:P53 mRNA选择性翻译

介绍两个知识点:同源异构体(isoform)和转录变异体(transcript variant)
同源异构体(isoform):由来自一个基因的mRNA前体因选择性剪接而产生多种mRNA,并翻译出多种蛋白,这些蛋白即为同源异构体。同一个基因的不同版本的蛋白。
转录变异体(transcript variant):由来自一个基因的mRNA前体因选择性剪接而产生多种mRNA,这些mRNA即为转录变异体。同一个基因的不同mRNA转录本。

p53 位于人染色体 17p13.1, 作为一个核序列特异性的转录因子, 主要包括 3 个功能结构域。N 末端的转录活化区 (transactivation domain, TAD), 通过与通用转录因子 (multi-subunit transcription factor D, TFD) 结合并相互作用而发挥转录激活功能。DNA 序列结合区域为中心活性区 (DNA-bindingdomain, DB), 可结合特定的 DNA 序列。C 末端四聚体化区 (tetramerization domain, TED) 可以使 p53 形成同源四聚体的活性形式, 除此之外还包括核定位信号 (nuclear localization signals, NLS), 富含亮氨酸的核输出信号 (nuclear export signal, NES) 和 C-末端结构域 (carboxy terminus domain, CTD)

p53 mRNA的选择性翻译产生两种同源异构体:p53全长(p53FL)和p53/p47。
p53全长(p53FL):在DNA损伤后激活ATM激酶(毛细血管扩张性共济失调症突变蛋白)从+1 AUG诱导p53FL合成。全长p53包含TAI结构域(反式激活结构域I),该结构域是诱导p53靶基因所需的,其中包括G1细胞周期激酶抑制剂p21(CDKN1A)或促凋亡因子如Bcl-2家族Bax、Puma和Noxa等等。

p53/p47:在向内质网施加应激后,未折叠蛋白反应(UPR)途径的激活引起激活PERK激酶。p53/ 47同源异构体在+120处的第二个框内AUG开始翻译。 P53/47缺乏TAI但保留TAII,通过诱导14-3-3导致G2/M周期停滞,或通过抑制BiP分子伴侣诱导BIK依赖的细胞凋亡。

友情提醒:
1. 艾博思客户在选择过表达质粒或者过表达慢病毒以及RNAi时候,一定要明确相应的基因的转录变异体(提供基因的Accession Number),查询文献调研不同的变异产生不同的功能,自己试验研究的是目标转录变异体务必要明确,如果选择有误可能会造成试验误差或者错误的结论。

2. 艾博思客户在选择蛋白表达和纯化时候,一定要明确相应的基因的同源异构体(提供蛋白Accession Number),查询文献调研不同的蛋白同源异构体的功能与结构域之间的关系,自己试验研究的是目标同源异构体务必要明确,如果选择有误可能会造成试验误差或者错误的结论。

p53 mRNA反应因子以及它们的位置与功能
聊聊p53mRNA

p53 mRNA 按照位置分为三大区域:5’非翻译区(5’UTR)、编码区(Coding region)和3’非翻译区(3’UTR)

5’非翻译区(5’UTR):成熟mRNA位于编码区(CDS)上游不被翻译为蛋白质的区域。该区域存在蛋白质结合位点,这可能会影响mRNA的稳定性或翻译、核糖开关、促进或抑制翻译起始的序列、5′非翻译区内的内含子与调控基因表达和mRNA出核转运有关等等。核糖体蛋白(RPL26)和核仁蛋白(nucleolin)相互竞争可以对p53的mRNA进行调控。p53基因5’端的非翻译区域就是与这两个蛋白相结合的区域。在健康的细胞中,核仁蛋白与mRNA的5’非翻译区域结合,P53蛋白的合成被抑制。但是在DNA受损后,RPL26结合到5’非翻译区域结合,使mRNA翻译出更多的P53蛋白。

聊聊p53mRNA

表1:P53 5’UTR 结合因子及其功能

编码区(Coding region):编码区是指转录的mRNA并能够翻译相应蛋白质的部分。PTB蛋白在遗传毒性的应激条件下与编码区相互作用增强p53和p53/47蛋白的翻译。同样,在遗传毒性的应激条件下,MDM2与p53 mRNA结合可以增强p53的翻译。
聊聊p53mRNA

表2:P53 编码区 结合因子及其功能

3’非翻译区(3’UTR):成熟的信使核糖核酸(mRNA)编码区下游一段不被翻译的序列。mRNA的3’非翻译区的功能复杂多样,不仅能调控其 mRNA 的稳定性、控制 mRNA 的亚细胞定位,而且还在特定氨基酸的编码过程中起着指导作用。例如多种 miRNA 在 DDR 中作用于 p53 的 3′UTR, 下调 p53的表达, 如 miR-155、 miR-125b、 miR-504、 miR-375等。在紫外损伤情况下HuR结合在3’UTR区域稳定p53 mRNA并且增强p53 mRNA翻译。
聊聊p53mRNA

表3:P53 3'UTR结合因子及其功能

p53 mRNA介导的在DNA损伤下MDM2对p53调控转换


聊聊p53mRNA

图2:p53 mRNA介导的调控机制
MDM2 通过介导 p53 降解和DNA损伤条件下调控转录活性的两种形式实现对 p53 功能的调节。
(A) MDM2 介导p53 穿过核膜进入胞浆降解。p53 可通过 MDM2 依赖途径和 MDM2 非依赖途径从核内向胞浆内转运。MDM2 与 p53 结合后, 通过特异性泛素蛋白连接酶(E3) 使 p53 蛋白的 C-末端上多个氨基酸位点泛素化,从而使 p53 能被胞浆中的蛋白水解酶识别并降解;p53的降解又可减少 MDM2 基因转录, 将 p53-MDM2负反馈环路关闭。
(B) 在DNA损伤情况下,MDM2 含有 1 个 p53 基因结合位点, 与p53 结合形成复合物, p53 蛋白急剧增加, 转录活性增强并诱导其负调节子 MDM2 的转录和表达。然而, 在 DNA 损伤应激下, MDM2 和 p53 均经历了一系列翻译后修饰作用, 从而破坏了两者之间的负反馈作用。ATM 可以直接磷酸化 MDM2 Ser386、Ser395、Ser425 和 Ser428, 还有 Thr419, ATR 磷酸化MDM2 Ser407, ATM 还可磷酸化 c-AB1 激酶进而磷酸化 MDM2 Tyr276 和 Tyr394。MDM2磷酸化以及p53 mRNA结合促进了与核糖体复合物(5S RNP)相互作用从而增加了p53蛋白翻译。

参考文献:
1. Haronikova, Lucia, et al. "The p53 mRNA: an integral part of the cellular stress response." Nucleic acids research (2019).
2. 王娅杰, et al. p53 在 DNA 损伤反应中的研究进展. Diss. 2011.


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