加载中…工具介绍：miRcode-长链非编码RNA转录组中假定的miRNA靶点预测图谱
(2013-05-15 13:02:34)
标签：
mirnalncrna相互作用靶标预测 |
分类： ncRNA |
工具介绍：miRcode-长链非编码RNA转录组中假定的miRNA靶点预测图谱
microRNA在细胞中的功能与作用的研究已经相对完善，而长链非编码rna功能是多种多样的，作为细胞生理作用的重要的调控因子，对于他们的研究才慢慢开始重视。少量的研究小RNA与长链非编码RNA之间相互作用表明，lncRNA可以作为抑制作用decoys(分子诱饵)或者miRNA的调控性的靶标起作用。但是这种作用仍然研究甚少。为了有利于miRNA-lncRNA相互作用，来自瑞典哥德堡大学的研究人员，开发了一种图谱工具miRcode:一种可以搜索的界面软件来预测miRNA靶点，目前版本，它覆盖完整的GENCODE注释的转录组，包括10419条已经注册的lncRNA。
AVAILABILITY:
-
Jeggari A, Marks DS, Larsson E.
(2012)
miRcode: a map of putative microRNA target sites in the long non-coding transcriptome. Bioinformatics 28(15), 2062-3. [article]
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