加载中…
个人资料
  • 博客等级:
  • 博客积分:
  • 博客访问:
  • 关注人气:
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
正文 字体大小:

艾博思生物转录组测序样品要求

(2012-06-20 15:27:27)
标签:

生物转录组测序

样品准备

教育

分类: RNA生物信息学
1. 艾博思生物质量控制体系
 
质量标准严格:QA系统为您的实验全程护航,实验严格按照153个SOP文件进行。 
实验记录完备:工厂化的流水线作业项目流程,保证所有实验记录可供回溯。 
多重实验质控:实验室QC、数据分析QC、项目QC—3重QC,减少低质量数据。

 
(1)样品运输和储存的质量控制
(2)实验过程的质量控制
(3)结果数据运输和储存的质量控制
 
 
2.艾博思生物RNA-Seq服务样品要求

A 样品要求(RNA)

1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.9~2.2 之间,RNA 28S:18S≥1.5推荐 RIN≥8;DNA 应该去除干净。

2) 样品浓度:最低浓度不低于100ng/µl。

3) 样品总量:每个样品总量不少于15µg。

4) 样品溶剂:要溶解在H20或TE (pH 8.0)中。

5) 样品运输: RNA用冻存管保存,并用干冰或液氮运输。
 


B 样本准备应该遵循的基本原则

1) 代表性原则:取样的代表性关系到实验结果是否具有科学意义,因此您应该根据实验目的慎重选择您的取样方案。病变组织样本中应不夹带正常组织,正常组织样本中不能含有病变组织。有条件时,应做到实验组与对照组的样本在取材时间、部位、处理条件等方面尽可能保持一致,否则可能会影响实验结果的可信度。

2) 准确性原则:代表性样本的各种特征数据必须被准确记录,并按要求(低温、迅速)采集、制备、贮存、运输,最终正确地按实验设计进行实验和数据处理。

3) 迅速性原则:样本质量是实验中影响实验结果的最关键因素,因此用于实验的样本,在采集、制备、贮存、运输过程中应尽可能地做到迅速,最大限度的缩短从样本采集到实验的时间。

4) 低温原则:所取样本离体后,应尽快置于液氮、干冰或-80℃冰箱中,并保证在实验前始终处于-70℃以下,以避免RNA的降解。


C 样本准备方法:详见《艾博思生物样品采集操作指南》


D 注意事项

1) 我们不接收未经TRIzol试剂处理的细胞样本。

2) 客户如果提供冻存可复苏的细胞株,应首先验证所用冻存方法用于RNA提取的可靠性,并且在送样时提供详尽的复苏方法,以便确保实验成功。

3) 关于样品编号及登记单:所有样本均应标明准确的样本编号,同时配有一张样本登记表,写明样本名称、物种、编号、取样日期、样本处理情况等。

4) 关于提取RNA的得率:处于不同发育阶段以及不同生长条件的样本中所含有的RNA 的量是不同的,在某些实验条件下或某些病变部位获得的样本中RNA的量可能与常规相应样本有显著的差异。储存条件以及储存时间也是影响RNA得率的关键因素,一般来说从新鲜的样本中总是能够得到预期的RNA产量,但是没有保存在液氮或-80℃冰箱中的样本是不可靠的。此外,即使是保存在液氮或-80℃冰箱中的样本,如果储存时间过长,RNA产量也会显著降低。因此,实验中细胞样本的需要量只能以本公司的抽提结果为准。

5) 关于备份:为确保实验的顺利,我们强烈建议您在取样时,应同时备份2~3份,如备份3份,则送给我们两份,如果备份2份,则送样一份,您自己留一份,以防备部分样本降解,重新取材或送样耽误您的时间。即使样本全部合格,备份的样本您还可以用来进行其他方面的实验(如定量验证,蛋白方面,生化方面的实验等)。备份又分为两种,一种为严格备份,即:样本取下后一分为二,这样的两份样本基本上具备同性质。另一种为非严格备份,即生物学重复的样本,这样的备份样本同质性要较前者差。 

0

阅读 收藏 喜欢 打印举报/Report
  

新浪BLOG意见反馈留言板 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 产品答疑

新浪公司 版权所有