小门地质馆位于西屿北端的小门岛，建成于2001年4月，本着环保、可持续性发展的理念，馆內设列着澎湖列岛的地质地貌、小门屿地景模型、岩石展示区、小门屿生态区、小门人文区、标本展示区等展区。

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小门村东边有一小道，正好夹在两边的高山之间，是以前村民出入的必经之路，远看就像是一道门户，所以这里就叫做小门。

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小门屿以前是和西屿连为一体的，因海水长期侵蚀，造成两地慢慢分离，后来只能靠建小门桥将两地联接。小门山上布满了澎湖传统的菜宅景观，就是通常所说的“蜂巢田”，以珊瑚礁石筑成方形围墙，以抵御东北季风对作物的影响。

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