合酶（synthase）与合成酶（synthetase）是生化教学中经常提到的，同时也是比较容易混淆的两个概念。

       例如，对于三羧酸循环中催化乙酰CoA与草酰乙酸反应生成柠檬酸的酶，国内教科书就出现了命名的混乱，有的书称为柠檬酸合酶，更多的书称为柠檬酸合成酶。此外,不少教科书把脂肪酸合酶、HMG-CoA合酶、ALA合酶及前列腺内过氧化物合酶，误译成脂肪酸合成酶、HMG-CoA合成酶、ALA合成酶及前列腺内过氧化物合成酶等。可见,合酶与合成酶误用，存在一定的普遍性。这种状况不仅使青年教师茫然，更使学生无所适从，实在有必要澄清。

　　出现这种错误的可能原因，一是名词的错译，二是合酶与合成酶概念的混淆。现以柠檬酸合酶为例，对合酶与合成酶加以辨析。

　　合酶与合成酶虽然在名称上只有一字之差，但并不是一种酶的两种称呼，而是两类不同的酶。

       根据国际生化学会对酶的命名原则，合酶属于裂合酶类，而合成酶属于连接酶类。裂合酶类催化非水解方式断裂作用，于其分子或原子团上留下双键；或者相反，在双键处加入某基团。当裂合酶类进行加成反应时,也可称为“合酶”。

       连接酶类水解ATP或其他高能三磷酸化合物的焦磷酸键时，偶联两个底物，新合成的化合物往往具有基团转移势能，只有这种酶,才能称为“合成酶”。

       在乙酰CoA和草酰乙酸的缩合反应中，乙酰CoA的甲基脱掉一个H，与草酰乙酸的羰基碳相连，形成一个碳-碳单键，甲基脱下的H与羰基氧形成羟基，生成柠檬酰CoA，后者不稳定，迅速水解出辅酶A，柠檬酸的生成，应属于裂合酶类催化的加成反应。因此，催化此反应的酶应为柠檬酸合酶(citrate synthase, E.C.4.1.3. 7)，而不是柠檬酸合成酶(citrate synthetase)。
　　解决合酶与合成酶误用和错译问题的途径，除在阅读和翻译英文教材时，予以特别注意外，根本的办法还是明确合酶与合成酶催化反应的异同。因为少数英文教材也有synthase与synthetase误用的情况，如在Harpers' Biochemistry中(R. K. Marray等编著，23版，1993，by Appleton & Lange)，同一作者对催化反应的酶就有乙酰乙酸CoA合酶(266页)和乙酰乙酸CoA合成酶(227页)两种命名，而显然前者是错误的。
　　由于对合酶与合成酶的误用和错译情况的普遍性，因此有关教师在编译和讲授合酶与合成酶时，给予一定的特别关注是必要的。

       合酶不耗能，合成酶耗能。合酶催化反应时不需要ATP，而合成酶需要ATP参与。

       合酶属于裂合酶(EC4)，合成酶是连接酶(EC6)，不同的类别合酶是synthase；合成酶是synthetase。合酶涉及双键，合酶是一种裂解酶，可将一种底物加合到另一种底物的双键上。合成酶需要ATP。不过，现在至少有一部分合酶被转移到EC2，比如柠檬酸合酶，现在是EC2.3.3.1。合成酶现在也都叫ligase了。

       裂合酶类(或称裂解酶类 lyases)，催化从底物上移去一个基团而形成双键的反应或其逆反应。这类酶包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。

       ATP合酶，同时有ATPase的功能，称为F型ATPase。ATP合酶可以催化逆反应，即ATP的水解。因此，从某种意义上来说，ATP合酶也是一类ATP酶。

       F型ATPase, 也稱為“Phosphorylation Factor”存在在各種生物中，利用電化學勢進行ATP的合成。
       P型ATPase，也稱為 E1-E2 ATPase ， 存在在細菌和真核細胞中，消費ATP進行離子運輸。
       V型ATPase，存在于液泡（Vesicle）膜，以及高爾基體，溶酶體上，消費ATP進行離子運輸
       A型ATPase，存在在古細菌（Archaea）中，雖然有F型ATPase 的功能--ATP合成，但是在結構上其更接近與V型ATPase， 反映了古細菌為適應極端條件的進化。

       ATP酶与ATP水解反应耦合的转运是一个严格的化学反应，即每分子ATP水解能够使一定数量的溶液分子被转运。例如，对於钠钾ATP酶，每分子ATP水解能够使3个钠离子被运出细胞，同时2个钾离子被运入。
       跨膜ATP酶需要ATP水解所产生的能量，因为这些酶需要做功：它们逆著热力学上更容易发生的方向来进行物质运输，换句话说，以膜为参照，它们可以将物质从低浓度的一边运送到高浓度的一边。这一过程被称为主动运输。

       1、P型离子泵(P-type ion pump)，或称P型ATPase。此类运输泵进行离子运输时，需要磷酸化(P是phosphorylation的缩写)，包括Na+-K+泵、Ca2+离子泵。

       2、V型泵(V-type pump)，或称V型ATPase，主要位于小泡的膜上( V代表vacuole或vesicle)，如溶酶体膜中的H+泵，运输时需要ATP供能，但不需要磷酸化。

       3、F型泵(F-type pump)，或称F型ATPase。这种泵主要存在于细菌质膜、线粒体内膜和叶绿体的类囊体膜中，它们在能量转换中起重要作用，是氧化磷酸化或光合磷酸化偶联因子(F即factor的 缩写)。

       4、ABC运输蛋白(ATP-binding cassettle transportor)，这是一大类以ATP供能的运输蛋白，已发现了100多种，存在范围很广，包括细菌和人。

       前3种泵只转运离子，后一种泵主要是转运小分子。