这个问题很容易解决，只要添加一个 .gitattributes

内容如下：

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# Auto detect text files and perform LF normalization

* text=auto

# Custom for Visual Studio

*.cs     diff=csharp

*.sln    merge=union

*.csproj merge=union

*.vbproj merge=union

*.fsproj merge=union

*.dbproj merge=union

# Standard to msysgit

*.doc diff=astextplain

*.DOC diff=astextplain

*.docx diff=astextplain

*.DOCX diff=astextplain

*.dot  diff=astextplain

*.DOT  diff=astextplain

*.pdf  diff=astextplain

*.PDF diff=astextplain

*.rtf diff=astextplain

*.RTF diff=astextplain

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git 完全支持 docx 文件的差异对比，因为 git 内部也是使用了 zlib，docx 本质上是 zip 文件,比较差异还是很容易的。

http://git-scm.com/book/en/v2/Customizing-Git-Git-Attributes