真三维GIS和二维GIS的本质区别在于数据分布的范围。对于一个二维系统来说，可以用一个表达式V=f(X, Y)来表示。其中，X、Y为二维平面的坐标，V为对应于此点的属性值。

　　地质现象特别复杂，而地层为最为重要的地质现象之一。地层是层状展铺的地层面分割的空间实体，有些地层存在交叉或尖灭，层与层之间是紧密的相邻关系。地层通常是一个不规则的曲面，不能用数学表达式表达。在三维GIS中，可以采用与数字高程模型类似的方法表达地层的界面。

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