3个重要数据库中人类GRCh38的下载和bwa或bowtie中人类的index下载
(2015-07-28 12:35:40)分类: biology |
Genecode:下载人类GRCh38的基因或基因注释文件:http://www.gencodegenes.org/releases/21.html
Ensembl:下载人类GRCh38的基因或基因注释文件:ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-77/fasta/homo_sapiens/dna/
NCBI: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/Eukaryotes/vertebrates_mammals/Homo_sapiens/和ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/H_sapiens/ARCHIVE/ANNOTATION_RELEASE.106/
在NCBI 中下载bwa或bowtie的GRCh8的index,下载地址子:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/Eukaryotes/vertebrates_mammals/Homo_sapiens/GRCh38/seqs_for_alignment_pipelines/
Ensembl:下载人类GRCh38的基因或基因注释文件:ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-77/fasta/homo_sapiens/dna/
NCBI: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/Eukaryotes/vertebrates_mammals/Homo_sapiens/和ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/H_sapiens/ARCHIVE/ANNOTATION_RELEASE.106/
在NCBI 中下载bwa或bowtie的GRCh8的index,下载地址子:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/Eukaryotes/vertebrates_mammals/Homo_sapiens/GRCh38/seqs_for_alignment_pipelines/
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