The Snp Consortium,
LTD.(TSC) http://snp.cshl.org/
Snp 研究联盟( TSC) 由美国冷泉港实验室(ColdSpring Harbour Laboratory) 等4
个研究中心共同构
建,他们的目标是在全基因组范围内寻找30 万个SNP ,并将与SNP 相关的信息公之于众。由之发现的SNP 数据也向dbSNP
提交。
美国麻省理工学院建立的SNP 数据库 http :/ / www2genome. wi. mit
. edu/ SNP/ human/ ;
日本( The Union of J apanese Science and Technology Corporation ,J
ST) 建立了J ST ( http :/ / snp . ims. u2tolkyo. ac. jp) 数据库
中国(华西医科大学和北京大学生命科学学院合作) 构建了Go ! Poly (http :/ / 61.139. 84. 5/
gopoly) 数据库等。
与疾病相关的突变数据库 Online Mendelian Inheritance in
Man (OMIM)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/
。OMIM并不列出在基因中的所有突变,而是集中于描述发现的第一个突变、最常见的突变和具有不寻常特征的突变。其中的临床信息对于医师和研究者很有用。OMIM
的记录中主要是关于基因和基因突变的文字描述,给出了历史记录、临床信息和分子信息,还有参考文献和对其他数据库的链接,许多甚至还包括了等位突变的信息。至2003
年2 月25 日,OMIM 包含了14 238 条数据记录。
KMDB/MutationView
http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp/
突变相关数据库( KMDB) [9 ]是日本庆应大学医学院( Keio University School of Medicine)
建立的一
个人类疾病相关基因的突变数据库,它目前的版本由9 个方面的疾病的子数据库组成,分别是眼睛、心
脏、耳朵、脑、癌、综合症、自身免疫、肌肉和血液。KMDB/MutationView是一个使用图表表现人类疾病引起基因的突变数据的数据库,它当前的版本是由的9个不同疾病种类的附属数据库组成,分别是眼睛,心,耳朵,大脑,癌症,综合症,自身免疫性,肌肉和血液。KMDB/MutationView收录了涉及87种不同的疾病的97种基因的突变数据并且可通过http://mutview.dmb.med.keio.ac.jp访问。
The Cancer Gene
Anatomyproject’s Genetic annotation Initiative(CGAP)
http://lpg.nci.nih.gov/GAI/
CGAP 遗传注释计划是为了寻找和确定与癌症相关的基因多态性,目的是为了理解癌症发生的分
子机理。CAI 一方面利用网上的SNP 信息进行数据挖掘,另一方面采取实验手段。此数据库发布经
过验证的和已确认的SNP 信息,同时也提供DNA多态的预测软件。
SCAN: SNP and CNV Annotation
Database
网址:http://www.scandb.org/newinterface/about.html
物种为人类(hg18/hg19)里面可以根据基因的位置,得到相应的SNP等等。 SNPnexus:http://snp-nexus.org/citation.html
类似SCAN.