吴纪敏是北京市戏曲学校1959年的首届毕业生，她与张学津、李雅兰、孙毓敏、赵慧英、金淑华、别永德、马永安、茹绍瑞等一起分到荀慧生剧团，当时她除演一些开场戏如《拾玉镯》、《柜中缘》等外，就是为李薇华、孙毓敏等配演二路旦角。但与其他同学相比，她是在荀剧团待的时间最长的一个，所以她的演出风格受荀影响颇大，也暗中学了不少荀的玩意。到1963年的时候，吴纪敏已然成为荀剧团主演之一了（该团并挂头牌的是两位正宗荀派——李薇华和荀令莱），以演青衣戏为主，如《女起解玉堂春》、《红鬃烈马》等。1964年荀剧团解体，她参加了梁益鸣、张宝华主演的鸣华京剧团（后相继更名北京新燕京剧团、北京风雷京剧团），这一时期，她曾演过荀派的《红娘》，此外，大多是现代戏《红灯记》、《沙家浜》、《龙江颂》等。
恢复老戏之后，吴纪敏如鱼得水。首先演出了全部《玉堂春》，而且一演就是数十场之多，这在当时的北京舞台绝无仅有。后来，她又陆续演出了《誑妻嫁妹》、《棒打薄情郎》等荀派戏，其中《誑妻嫁妹》也是当时北京的头一位，即使是荀令莱、孙毓敏等荀门正宗，也在她之后。