1、加碳酸钙的原因：保护色素，防止在研磨时叶绿体中的色素受到破坏。不加碳酸钙，滤液会变成黄绿色或褐色。叶肉细胞中，光合色素所处的环境呈弱碱性，实验中，液泡中呈酸性的细胞液由于研磨流出。在酸性条件下，叶绿素分子中的镁被H+所取代而形成褐色的去镁叶绿素，去镁叶绿素迅速分解出叶绿醇，形成去镁叶绿酸，而使溶液呈褐绿色。

2、滤纸条为何要剪去两角？  由于液面的不同位置表面张力不同，纸条接近液面时其边缘的表面的张力较大，层析液沿滤纸边缘扩散过快，而导致色素带分离不整齐的现象。故而在插入层析液的滤纸条一端剪去两个角。滤纸条边缘的层析液分子相互碰撞的机会少，扩散速度快，而滤纸条中央的层析液分子相互碰撞的机会多，扩散速度慢（边缘效应）。一端剪去两角，使两侧层析液上升的路线延长，克服边缘效应，从而使色素带在滤纸条上扩散平整。

3、在过滤时选用脱脂棉或纱布，而不用滤纸。原因主要有下：（1）色素分子比较大，不容易透过滤纸；（2）滤纸有较强的吸附性而使色素吸附在滤纸上，从而降低色素浓度，影响实验效果；（3）叶绿素是脂溶性，根据相似相容的原理，脱脂棉可以减少实验过程中色素的流失，增强实验效果。 

4、加入少许二氧化硅是为了磨碎细胞壁、质膜、叶绿体被膜和光合片层使色素溶解于丙酮中。