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新型冠状病毒36:一种化学物质与DNA结合时,DNA会受损

(2020-02-14 16:14:08)
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财经

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富田兴合苑业主的大事小事36、新型冠状病毒36一种化学物质与DNA结合时,DNA会受损

 

胡晋川(复旦大学青年研究员)研究方向:课题组利用生化方法和高通量测序技术研究染色质环境中的DNA损伤与修复,主要包括紫外线和抗癌药物顺铂()等造成的DNA加合物损伤以及相应的核苷酸切除修复。

…生化方法、高通量测序技术、铂、顺铂、染色质:见《富田兴合苑业主的大事小事33~35》…

…加:两个或两个以上的东西或数目合在一起:二~三等于五。功上~功

…合:结合到一起;凑到一起;共同(跟相对):~办。同心~力

…加合物:指的是两个或多个不同的分子,通过互相加合得到的产物。典型的加合物如三氟化硼(BF3氨(H3N加合形成的H3N→BF3。可以用箭头或者圆点在分子之间作为表示方法

DNA加合物adductsDNA片段与致癌化学物质结合形成的复合物,在科学实验中通常作为暴露的生物标注物。

DNA加合物是化学毒物经生物系统代谢并活化后的亲电活性产物与DNA分子特异位点结合形成的共价结合物。

当一种化学物质与DNA结合时,DNA就会受损,DNA复制和细胞复制等生物过程将无法正常进行。这种结合激活了DNA的修复过程。如果受损的DNA没有受到有效的修复,就可能导致癌症的发生活性:见《富田兴合苑业主的大事小事17

特异:见《富田兴合苑业主的大事小事29

…共价键:见《富田兴合苑业主的大事小事6…)

…核、苷、核苷、酸、核苷酸:见《富田兴合苑业主的大事小事25

 新型冠状病毒36:一种化学物质与DNA结合时,DNA会受损


胡晋川(复旦大学青年研究员)研究方向2课题组长胡晋川在2015年诺贝尔化学奖得主Aziz Sancar教授实验室做博士后期间,主导开发了Damage-seqXR eXcision Repair-seq方法,分别是目前唯一能以单碱基分辨率检测人类基因组上各种DNA加合物损伤位置和核苷酸切除修复发生位置的高通量测序方法。在此基础上,课题组围绕DNA复制与转录对核苷酸切除修复的影响、DNA损伤修复与染色质状态变化的相互作用、修复与癌症基因组突变发生的联系以及修复与顺铂抗药性的关系等问题开展研究

…碱:在水溶液中电离出的阴离子全部都是OH-(氢氧根)的物质;电子给予体(化学反应中失去电子的一方)

…基:化合物的分子中所含的一部分原子,被看作是一个单位时就叫基:羟~(—OH)。氨~(NH2…见《富田兴合苑业主的大事小事4》…

碱基碱基在化学中本是“碱性基团”的简称。有机物中大部分的碱性基团都含有N原子,称为含氮碱基。氨基(-NH2是最简单的含氮碱基

碱基对:是一对相互匹配的碱基(即A—TG—CA—U相互作用)被氢键连接起来。它常被用来衡量DNARNA的长度(尽管RNA是单链)

单碱基:单独的碱基。通常指A T G C U中其中一个碱基

A[腺嘌(piào)呤(lìng]T[胸腺嘧()啶(dìng]G鸟嘌呤)、C胞嘧啶)、U尿嘧啶):组成核酸和核苷酸的碱性基团(碱基)见《富田兴合苑业主的大事小事16

分辨:辨别:~是非。天下着大雨,连方向也~不清了

能以单碱基分辨率能辨别单碱基

 

2019-05-11 08:20网友“表现遗传学”发了篇名为“详解 UV 诱导的 DNA 损伤和修复”的论文。

Uvultraviolet的缩写

ultraviolet(英文):n.紫外线…见《富田兴合苑业主的大事小事28

n.:英文noun的缩写,意思是名词

在分子生物学研究中我们经常使用 DNA 损伤模型其中非常常见的一种手段是 UVUV 照射后,DNA 损伤形式是怎样的?DNA 损伤后,细胞又是怎么修复的呢?如何检测全基因组的 DNA 损伤和修复事件呢?DNA 损伤修复异常与疾病又有怎样的联系?…”网友说,本文整理了复旦大学胡晋川研究员2017 年发表的题为The Cartography of UV-induced DNA Damage Formation and DNA Repair(紫外线诱导DNA损伤形成与修复的制图)的论文 综述文章的核心要点,以期对上述问题进行解答…”

 新型冠状病毒36:一种化学物质与DNA结合时,DNA会受损


详解 UV 诱导的 DNA 损伤和修复》论文第1部分:UV 诱导的三种损伤

UV 按照波长可分为三类:UVA315~400 nmUVB280~315 nmUVC100~280 nm。其中抵达地球表面的UV中,95% 以上是 UVA,其余是 UVB,而 UVC 被大气层阻断…”网友说,“波长越长,穿透能力越强UVA 的穿透能力最强;而根据 E=hc/λh 为普朗克常量,c 为光速E为能量,λ为波长),波长越短能量越高UVC 的能量最高。

nm:纳米

…纳米:1nm=10-9m1纳米=10的负9次方米

E=hc/λ:能量=普朗克常量×光速)/波长

UV 造成的 DNA 损伤中,最主要为嘧啶二聚体,包括环丁烷wán嘧啶二聚体、嘧啶6-4嘧啶酮tóng光产物,以及它们相关的杜瓦价键异构体(Dewar valence isomers…”网友接着说。

、嘧啶:见《富田兴合苑业主的大事小事9》…

…二聚体、嘧啶二聚体环丁烷嘧啶二聚体:见《富田兴合苑业主的大事小事23~25

…酮:一类有机化合物其特征是含有与两个碳原子相连接的羰tng这两个碳原子通常包含在两个烃tng基中如在通式RCOR

新型冠状病毒36:一种化学物质与DNA结合时,DNA会受损
[羰基C=O):见《富田兴合苑业主的大事小事4》…

烃基烃分子失去一个或几个氢原子H而成的基团,通常用R[英语单词“radical”(基)的首字母]表示,如烷基、烯基、芳香基等(百度汉语);化学中被用来指只含碳两种原子的基团,一般指相应的失去一个氢原子后剩下的基团,甲基(-CH3乙基(-C2H5为最常见的两种烃基(百度百科)]

 

日光中的 UV 主要造成环丁烷嘧啶二聚体抵达地球表面的UV中,95% 以上是 UVA…见《富田兴合苑业主的大事小事36》);此外,UVA 还可以将嘧啶6-4嘧啶酮光产物转化为杜瓦价键异构体

请看下集《富田兴合苑业主的大事小事37、新型冠状病毒37:日光中的紫外线主要造成环丁烷嘧啶二聚体

若不知晓历史,便看不清未来

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