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cFDNA和ctDNA研究用采血管—CFGenome

(2017-06-01 14:44:31)
标签:

cfdna

ctdna

无创产前检测采血管

无创产前诊断

循环肿瘤检测

分类: 群晓推广

Exo DNA ProTeck®采液管 (Blood Exo DNA ProTeck® Tubes)

用于cf DNActDNA的血液收集管(采血管)

22°C/71.6°F下,cfDNA可以稳定保存28

在超过40°C/104°F下运输,cfDNA依旧稳定

无甲醛

 

(一)cfDNA稳定性

Blood Exo DNA Pro-Teck® Tube可实现全血采集样品中cfDNA规范化(标准化)。可用于无创产前基因筛查/无创产前基因检测(NIPS/NIPT)和液体生物监测(液体活检,Liquid Biopsy)的规范化,提高检验结果的准确性。

1. 时间稳定性(Time Stability)

CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血,其Cell-free DNA可以在室温(22C) 下能稳定保存长达28天!

结论来自如下监测:在不同时间下,对室温保存在CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tubes中的血液,取血浆使用droplet digital PCR检测β-Actin基因片段,用以反映cell-free DNA浓度,发现与初始采集时比较,保存长达28天后该基因没有发生显著改变。而K3EDTA采血管无法实现在室温下的长时间保存。在第3天,β-Actin已经呈现显著升高,cell-free DNA浓度持续升高,至28天时,浓度升高上千倍之多。

2. ctDNA稳定性

Blood Exo DNA ProTeck® tubes保存血样,血液中的肿瘤DNA室温(22C)稳定保存28天。

该结果来自于对野生型KRAS DNA浓度的检测:Blood Exo DNA ProTeck® tubes能让血液中的KRAS DNA室温(22C)稳定保存28天,而K3EDTA保存管无法实现。

将来源于细胞系的已知量的KRAS外显子2 G13D突变的肿瘤cell-free DNA作为内参照加入到采集的血样中,使用therasreen KRAS RGQ PCR试剂盒和Rotor Gene real time PCR仪检此内参。在K3EDTA采血管保存的血样中,发现仅在采集日可以检出,而Blood Exo DNA ProTeck® tubes中保存的血样,22°C下保存28天依旧可以检出。

3. 温度稳定性(Temperature stability)

使用CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tubes采集的全血在4C30C间都能保持cell-free DNA稳定。

无论使用Qubit® dsDNA HS检测法,还是使用droplet digital PCR检测RASSF1A,在CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tubes中,6C, 22C37C三种保存温度下保存的血液,直到第7cell-free DNA浓度都没有显著改变。

4. 运输稳定性(Shipping stability)

使用CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tubes采集保存的血样能经受42C温度,不影响血中cell-free DNA浓度。

实验方法:将ProTeck采血管采集的血样,通过FedEx运输往哥伦比亚,亚利桑那等地,经受两天42C,与室温保存的样品比较cell-free DNA浓度没有显著改变,而在K3EDTA管中保存的血样cell-free DNA浓度显著升高(droplet digital PCR技术检测β-Actin基因片段)

5.甲醛检测

NMR检测显示CFGenomeBlood Exo DNA ProTeck® tube不含甲醛。

(二)ctDNA 稳定性

室温(22°C)下,保存在K3EDTA采血管中的血样,野生型KRAS DNA浓度随时间延续升高,而Blood Exo DNA ProTeck® Tubes中的血样可以保存28天。

实验方法:使用来自细胞株的KRAS外显子2 G13D突变的肿瘤cell-free DNA作为内参添加入血样中。存放在K3EDTA采血管的血样中,仅在采集当天能检测到突变DNA,而Blood Exo DNA ProTeck® Tubes保存的血样,室温保存22天依旧可以检测到。

 

其它产品

1.       KRAS Control

KRAS Control®KRAS exon 2 G13D cell-free DNA提取内参照,用于体外非侵入性肿瘤检测(液体检测Liquid Biopsy)中。这一产品旨在提供一种用于证明患者血样提取cell-free DNA过程成功与否的参照物,也是检测方法的参照物。

CFGenome的这一参照物是真正的cfDNA,市场上其他产品使用的是合成DNA或是基因组DNA片段化产物。

这一参照系统含10%KRAS突变型(exon 2 G13D)cell-free DNA90%为野生型KRAS的无细胞DNA作为背景。

2.       TriZo 21 Control™

TriZo 21 Control™是胎儿21号染色体三体的cell-free DNA提取对照物,用于体外非侵入性产前21三体综合征的诊断。旨在对提取过程提供参照。这一参照系统含10%21三体的cell-free DNA90%野生型的cell-free DNA作为背景。这一对照也作为方法的对照使用。

CFGenome的参照物使用的是真正cfDNA,市场上其他产品使用的是合成DNA或是基因组DNA片段化产物。

CFGenome还有TriZo 18 Control™ and TriZo 13 Control™等产品。

 

由群晓科苑翻译整理,科学推广,服务民众。他人或机构如需使用,请提供该原始链接地址。

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