Sanger测序、新一代测序(NGS)所需样品前处理和制备—Aline产品

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sanger测序新一代测序下一代测序测序样品制备测序文库构建 |
分类: 群晓推广 |
Aline Biosciences (ALINE)致力于向全球客户提供用于基因组研究的最高质量和最佳效果试剂。
ALINE专门生产基于磁珠技术的创新性专利生物产品。从2009年开始,ALINE已设计、制造了多种用于测序平台和DNA/RNA样品制备的磁珠(专利)产品。ALINE产品以优良的品质赢得了包括500强企业,CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments)认证遗传诊断实验室,知名基因组研究中心和NGS测序服务企业在内广布在世界各地用户的的信任。
http://s15/small/0023pY0vgy6QEHD9Bca4e&690
ALINE做什么?
基于磁珠的试剂盒
Sanger测序所用纯化(cleanup)产品
新一代测序所用纯化产品
DNA/RNA/microRNA提取产品
DNA均一化(normalization)产品
DNA大小筛选产品(DNA Size Selection)
产品类型
NGS文库纯化(cleanup)
DNA纯化(purification)试剂盒
RNA纯化试剂盒
NGS均一化试剂盒
Sanger测序试剂盒
NGS文库预制备(Prep)试剂盒
包括如下物种产品:DNA Molar Normalizer,DNA Normalizer V2,DNA SizeSelector - II,DNA SizeSelector-I,PCRClean DX,RNA MagClean DX。
简要描述
新产品。DNA均一化试剂盒基于DNA分子数量而不是重量进行标准化,标准化后,大DNA分子和小DNA分子将具有相似的数量。适合不同长度片段PCR产物的混合,用于NGS。
详细描述
相同重量的DNA,对于小分子DNA而言,将在数量上大量超过大分子DNA。基于重量均一化DNA分子导致的结果将是:对于相同纳克DNA,长链DNA分子数将远少于短链DNA分子。因此,对于长度不同的PCR产物,基于DNA分子数量进行均一化处理十分必要。ALINE专利的顺磁珠(paramagnetic beads)产品具有固定的DNA结合能力和根据DNA长短尺寸区分(differentiate) DNA能力。经molar DNA均一化后,不同长度的DNA分子(分子量)在均一化后的溶液中数量类似。
这一试剂盒适合PCR产物的均一化处理。
简单描述
USA专利产品。在不同的DNA样(例如PCR产物)中,均一化靶标DNA片段。
详细描述
DNA Normalizer基于Aline专利的顺磁珠技术研发。这种顺磁珠具有固定的DNA结合表面,因此,通过限制纯化反应体系中磁珠的量,用户可分离获取预先设定的DNA量。通过此纯化过程进行DNA均一化处理,可省掉额外的DNA定量和稀释过程,大量节省时间,劳力和试剂。PCR扩增产物(amplicons)可选择该产品实现标准化,并通过简单一步混合,用于新一代测序文库的构建。利用该试剂每次可获得100 ng DNA。
流程
I.
II.
III.
步骤简单,可在thermal cycling plate上完成,无需离心和过滤。可自动化,实现高通量。
下游(down stream)应用
用于新一代测序平台,如Illumina, Ion Torrent, PacBio, Roche/454, SOLiD的文库制备
毛细管测序
任何其它的分子工程平台
产品特点:
双重功用(dual action):均一化和PCR纯化一步实现,节省流程,高效省时
无需离心和过滤
通量灵活(Scalable):可选择离心管,96或384孔板
易于操作与实现自动化
简要介绍
筛选用于Illumina和Ion Torrent新一代测序的文库DNA长度
详细描述
是为Illumina和Ion Torrent应用而在SizeSelector-I基础上开发的新版产品。经优化实现对300到800 bp大小范围DNA的回收。ALINE专利的基于磁珠DNA筛选产品具有更高的DNA回收和分离效率。这种方法具有灵活的通量和高的调整能力,你可以根据需要分离相应DNA。与其它基于珠子的DNA分子大小筛选方式相比,DNA SizeSelector-I一致性更高,选择此产品能把批次间差异降到最低。
产品特点
为Illumina和Ion Torrent设计,性能卓越的DNA片段长度筛选产品
多能,灵活的序列片段选择能力:无需使用凝胶
有效去除引物二聚体:无需进一步纯化
易于操作和实现自动化
通量灵活:可选离心管,96或384板
无需离心,负压(vacuum)或过滤。
简要描述
用于在新一代测序文库制备,有效去除接头分子(adaptor),高效获取所需大小片段范围的DNA。
细节描述
用于NGS文库构建。专为Illumina and SOLiD平台开发,最适合回收200-700bp范围DNA。ALINE专利的基于磁珠的DNA筛选产品,回收效率更高,DNA分离能力更好。这种方法通量高、可调,能根据你的意愿实现对感兴趣DNA的分离。与其它DNA片段分离方式相比,DNA SizeSelector-I应用更简单,结果重现性高,能最大限度降低批次间差异。
特性
卓越的接头去除能力
适用于Illumina, Ion Torrent, PacBio, Roch/454和SOLiD平台,高的片段筛选能力
优化的,柔性(flexible)流程
高效去除引物二聚体,无需进一步纯化
操作简单,易于实现自动化
下面提供两篇使用该产品的文献供参考
Tan et al., Molecular Biology of the Cell, 2014,
https://reck-peterson.med.harvard.edu/sites/reck-peterson.med.harvard.edu/files/publication_pdf/Tan_2014.pdf
KH Wong et al., Current Protocols in Molecular Biology, 2013, 101:7.11 1-7.11.11: Multiplex Illumina Sequencing Using DNA Barcoding, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23288465
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3505986/
1.5 PCRClean DX
简要介绍
在寻找替代Bechman Ampure XP的方式吗?PCRClean DX花费更低。
产品细节
PCRClean DX试剂盒使用ALINE专利的顺磁珠技术,快速纯化DNA片段。PCRCean DX用于直接取代Beckman's Ampure XP,无需改变任何流程,而同时带给用户NGS文库制备更优良的接头去除能力,更高的引物二聚体移除效率。
应用
用于Illumina, Ion Torrent, PacBio, Roche/454和SOLiD等二代测序平台
Sanger测序所需PCR产物的纯化
基因分型和突变检测
引物步移(Primer Walking)
用于其它下游分子工程中
产品特点
纯化(clean-up)更灵活:通过不同的实验流程可实现对>100 bp或>60 bp amplicons的高效回收
高效去除dNTPs,引物二聚体,盐和其它杂质。
处理时间:15分钟/96样品
通量灵活:离心管,96或384孔板
订货信息
Catalog Number |
Product Size |
C-1003-5 |
PCRClean DX, 5mL. 300 rxns |
C-1003-50 |
PCRClean DX, 50mL. 3,000 rxns |
C-1003-250 |
PCRClean DX, 250mL. 15,000 rxns |
C-1003-450 |
PCRClean DX, 450mL. 27,000 rxns |
C-1003-Bulk |
PCRClean DX, largest size. |
参考应用该产品的文献:
Sun et al. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2012
http://www.pnas.org/content/110/9/E808.full.pdf+html
简要描述
RNA样品纯化,RNAClean XP的替代品
产品细节
该试剂盒设计用于RNA样品的纯化,除去盐,酶和其它的潜在杂质。RNA经简单三步实现纯化,1. 结合,2. 70%乙醇清洗,3. 洗脱。过程可自动化,实现高通量RNA纯化。
应用
RNA测序
体外转录
芯片
RT-PCR
优点
完全的去除盐,多余引物和dNTPs
操作简单,容易实现自动化
水相(aqueous)洗脱
同时纯化cDNA和cRNA
产品包括如下类型:Buccal Swab gDNA Kit,DNA Concentrator - MX,FFPE MagaPure,PureGenome Blood gDNA Kit,PureGenome Plant gDNA Kit,PureGenome Tissue gDNA Kit,SequeMid Plasmid Prep。
简要描述
在口腔拭子(Buccal Swap)中分离gDNA
产品细节
该试剂盒设计用于使用专利的磁珠技术分离口腔拭子中的基因组DNA。其提取的DNA具有极高的得率和质量。
适合96孔板和1.5mL离心管应用
简要介绍
一步实现DNA的浓缩和纯化
产品细节
该产品使用了专利的顺磁珠技术
可高通量使用
可同时实现DNA样的浓缩和纯化
可出色提取低丰度,差质量样品DNA
花费低廉
简要描述
FFPE (formalin-fixed, paraffin-embedded)组织中DNA,RNA, microRNA的纯化
产品细节
FFPE组织DNA,RNA, microRNA的纯化。设计用于高通量,适合现今市场上所有主要液体处理工作平台的使用
高效
ALINE FFPE MagPure与Agencourt® FormaPure®的流程可交互应用
简要描述
血gDNA分离试剂盒
细节描述
使用专利磁珠技术,用于哺乳动物血gDNA的手动或高通量分离。该流程可以96孔板或是离心管形式完成。每次提取的得量为平均4到8微克。所获DNA质量高,得量大。与其它DNA纯化产品相比,不产生gDNA拖影(shearing gDNA)。gDNA完整度高,最适合用于长PCR (long PCR)和NGS文库的构建。纯化的gDNA能用于PCR,限制性酶切和基因型分析。
该试剂盒与Beckman's Genfind V2相当。
简要描述
植物gDNA分离试剂盒
产品细节
PureGenome植物/种子gDNA试剂盒用于在叶片,花朵和种子等各类植物样品中简单、快速分离gDNA,获得无抑制剂(inhibitor)、适合PCR反应的gDNA。流程简单,可自动化实现高通量gDNA提取。使用这一基于磁珠的产品可有效去除多糖,多酚和单宁(polyphenols/tannin)。
洗脱所获DNA适合PCR,新一代测序和基因型分析等
简要描述
用于组织gDNA分离
细节描述
用于动物组织样和唾液中自动、高通量提取gDNA。一次可处理10 mg组织。所获gDNA适合PCR反应,酶切消化。可与DNAdvance试剂盒媲美,与Oragene的唾液收集管兼容。
简要介绍
质粒,cosmid制备
产品细节
这一基于磁珠技术的产品用于在大肠杆菌中自动化,高通量的纯化质粒,cosmid,formid。所获质粒适用于高通量DNA测序。可与CosMCPrep媲美。
包括FFPE MagaPure和RNA MagClean DX两类产品。
FFPE MagaPure见先前2.3的介绍。RNA MagClean DX见先前1.6的介绍
包括DNA Molar Normalizer和DNA Normalizer V2
详情见先前1.1和1.2介绍。
包括PureSEQ,PureSEQ-MP和SequeMid Plasmid Prep。
简要描述
用于sanger测序中BigDye terminator的去除和盐纯化,获取高效、一致的质量。
产品细节
用于ABI 3730中,BigDye,引物二聚体和其它杂质的去除和纯化,质高价廉。品质至少与Agencourt CleanSEQ相当。价格节省至少50%。(BigDye和CleanSEQ分别为Life Technology和Beckman Coulter, Inc.产品)
ALINE PureSEQ使用ALINE专利的磁珠测序纯化体系,用于Sanger测序过量BigDye terminator的清除。能最大限度移除测序反应中的杂质,如盐和未掺入的terminators。该产品为CleanSEQ替代物,操作步骤与CleanSEQ相同。
特点与优势
获得测序结果更准确,读取长度更长
高的平均信号强度
手动或自动化友好
无需离心或过滤
简要介绍
特为新客户提供!PureSEQ产品线中最新,最有力,具独特性质的产品
细节描述
是ALINE BigDye去除/纯化产品线中的最新产品,具有最好的效率。可有效去除dye terminator,盐和其它杂质。更多能、有效,使用该产品用于测序纯化(cleanup)可获取最高质量的测序结果。
特点与优势
384或96孔板可用,尤其适合384孔板模式。
所获高质量测序序列更长
适合更宽范围DNA模板浓度范围,包括低浓度的DNA模板
更低的重复率
纯化步骤与常规PureSEQ相同
详情见2.7介绍。
产品包括DNA NGS Library Prep Kit - for Illumina和RNA NGS Library Prep Kit - for Illumina
简要介绍
经优化的自动化DNA文库准备试剂盒,含条形码。
产品细节
在多种NGS中应用。可用于各物种gDNA文库,长扩增产物(amplicon)测序和从mRNA转录生成双链cDNA。
特点与优势
操作时间只约2小时
易于自动化
经过了全面的优化处理
这一试剂盒为单管反应(single tube reaction),用于末端修复(end repair)和dA加尾。磁珠用于这两步之间的纯化过程。流程可实现自动化。用户可选择省略位于末端修复和链接之间的纯化步骤,从而节省2-3小时时间(视样本数量多少)。可咨询获取关于该产品的更多信息。
简要介绍
使用Illumina平台直接进行RNA测序获取整个转录组
细节描述
此RNA文库制备试剂盒为单管反应,一天内完成,手动处理时间短。只需简单流程,测序后可或RNA转录本信息。用于RNA从头(de novo)测序和转录本鉴定。使用该试剂盒可使用低达10ng mRNA,经简单流程成功完成RNA文库制备。
特色与优点
更高的得率—整个转录组的直接测序
更简单的工作流程—省略了第二链cDNA合成步骤和接头连接步骤
所需材料更少—低到10ng mRNA
单管内反应,一天内完成
群晓科苑为ALINE授权的中国大陆代理商,如果您对ALINE产品感兴趣,需要相关技术资料或价格咨询,请随时联系!
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