1994年“民航运输服务质量上台阶活动”获全国第四名以及中南地区第一名

1994年“十万旅客话民航”活动中获空中服务全国第一名

1995年5月1日 深航荣获深圳市人民政府颁发的“深圳市一九九四年度先进企业（单位）

 1996年5月深航乘务大队被团中央、民航总局团委评为全国“青年文明号”

1997年5月深航被中共深圳市委 深圳市人民政府评为“深圳市1995-1996年先进企业（单位）”

1997年5月深航华联售票处被团中央、民航总局团委授予全国“青年文明号”称号

1997年7月1日 深航荣获中国民航协会用户工作委员会 全国民航青年志愿者协会《中国民航》杂志联合颁发的“96旅客话民航”用户评价第一名

1997年7月深航荣获中国民用航空总局颁发的“1996年中国民航优质服务奖”

1997年12月深航荣获中国质量管理协会全国用户委员会颁发的“用户满意企业”奖

1997年12月深航荣获中共深圳市委 深圳市人民政府颁发的“文明企业”奖

1997年 深航荣获中国民用航空总局颁发的“航空安全先进集体”称号

1997年 深航荣获深圳市人民政府颁发的“深圳市第三届（1997年度）守法纳税大户”奖牌

1998年3月深航荣获中国民用航空中南管理局颁发的1997年中南地区机务系统“0事故征候”活动先进单位

1998年6月18日 深航荣获中国民航协会用户工作委员会 全国民航青年志愿者协会《中国民航》杂志颁发的“97旅客话民航”用户评价第一名

1999年6月深航荣获中国民航协会用户工作委员会颁发的“九八旅客话民航”用户评价第一名证书

1999年6月深航荣获中国民航协会用户工作委员会颁发的“九六----九八旅客话民航”用户评价“三连冠”证书

1999年6月深航荣获全国用户满意联合推进办公室颁发的“九八全国实施用户满意工程先进单位”证书

1999年7月22日 深航被中华全国总工会 全国职工职业道德建设指导协调小组评为“第五届全国职工职业道德十佳单位”(榜首)

1999年9月深航荣获中共广东省委 广东省人民政府颁发的“广东省文明窗口”证书

1999年9月深航4G823/4航班被中央精神文明建设指导委员会评为“全国创建文明行业工作先进单位”

2000年6月深航连续第四年荣获中国民航协会用户工作委员会颁发的“99旅客话民航”用户评价第一名

2001年1月深航机上杂志《深圳航空》被广东企业文化协会、广东省新闻学会评为“2000年度最佳企业报刊”

2001年 深航荣获第二界全国民航B737机型青年岗位能手技能运动会“优秀奖”

2001年10月深航连续第五年荣获中国民航协会用户工作委员会颁发的“全国旅客话民航”用户评价第一名

2002年5月深航维修工程部外场中队、商务部机场办被驻深团工委授予“青年文明号”称号

2002年8月深航乘务部获得了北京市中航哈佛德质量认证有限公司颁发的“航空运输空中服务” GB/T19001-2000 idt ISO9001：2000标准质量认证证书

2002年12月深航荣获中国民航协会用户工作委员会颁发的“全国旅客话民航”活动（1993-2002）先进企业金奖

2003年4月深航被广东省委 省政府评为“广东省先进企业”

2003年5月深航货运公司燕南路营业部被团中央、民航总局团委授予全国“青年文明号”称号

2003年 深航被评为深圳市守法纳税大户

2005年2月 在“2004旅客话民航”用户满意评价活动中，公司在旅客运输量1500万人以下组中，获得“用户满意优质奖”和单项奖中的“航班不正常服务优秀奖”

2005年9月 公司被民航总局规划发展财务司评为民航机场管理建设费征收与清算工作先进单位

2006年1月 公司在2005年度旅客话民航活动中获得旅客运输量1500万人次”用户满意优质奖”

2006年1月 在2005年度民航“旅客话民航”用户评价活动中,公司继2004年后再次喜获“用户满意优质奖”荣誉

2006年12月 继连续八年被评为全国民航“旅客话民航”第一名后，深航在全国满意服务评选中再次获得2006年“全国用户满意服务”奖

2006年12月 公司荣获亚太航空中心年度最佳经营优秀奖

2007年9月 深航荣获2007年度深圳市市长质量奖

2007年 荣获“中国企业文化示范基地”称号
2004—2007年 连续四年荣获全国“安康杯”优胜企业

2008年 荣膺“国际五星钻石奖”
2008年 荣膺“深圳市知名品牌”
2008年 荣膺 “中国500最具价值品牌”称号，位列国内民航前三甲
2008年 通过ISO14001环境管理体系、OHSAS18001职业健康安全管理体系认证
2008年 荣获中华全国总工会抗震救灾“工人先锋号”
2008年 荣获广东省抗震救灾先进集体
2008年 荣获深圳市先进基层党组织
2008年 荣获“中国10大雇主品牌”
2008年 荣膺“亚洲品牌500强”，位列国内民航第二名
2008年 荣膺“30年影响深圳人生活的功勋品牌”
2008年 荣获党建、企业文化双十佳

2009年 荣膺“深圳企业百强”

2009年 荣获“飞行安全一星奖”
2009年 荣膺 “中国500最具价值品牌”称号，位列国内民航第二名
2009年 首次跻身“中国企业五百强”
2009年 再度荣膺“亚洲品牌500强”，位列国内民航第二名