DNAstar软件的使用（三）Ｓeqman 拼接序列_唐明智

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DNAstar软件的使用（三）Ｓeqman 拼接序列

(2011-05-07 22:29:31)

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分类：生物软件的使用

启动Seqman，点击面板中的Add sequence　按钮添加将要拼接的序列
 http://s13/middle/6e71a09fha2b907cce12c&690拼接序列" TITLE="DNAstar软件的使用（三）Ｓeqman 拼接序列" />

选中目标序列，点击Add--Done导入目标序列

如果导入的是峰图文件，可以双击文件名会弹出峰形图，通过移动黑色的分隔线可以去除测序质量不高的区域（黄色区域），从而避免在拼接过程中产生模棱两可的数据。

数据修正后点击Assemble即拼接，运行结束后会弹出一个新对话框，如果能拼接上，则在Contig一栏有显示。

双击Contig可以看到拼接好的完整序列，以及两个峰图的重叠区域，如果两个峰图的重叠区域完全匹配，则表明拼接的结果可靠；如果两个峰图间有不同碱基，则需要比对两个峰图，选择峰图清晰的作为最终结果。

http://s9/middle/6e71a09fha2b903077148&690拼接序列" TITLE="DNAstar软件的使用（三）Ｓeqman 拼接序列" />

点击文件前面的三角形可以直接查看序列的峰形图

点击菜单栏的Contig--Save Consense--Single File 可以保存拼接好的序列。

http://s10/middle/6e71a09fha2b077060af9&690拼接序列" TITLE="DNAstar软件的使用（三）Ｓeqman 拼接序列" />

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