峰图的基本知识
(2011-05-07 21:02:34)
标签:
dna测序峰图序列杂谈 |
分类: 测序常见问题分析 |
测序公司发送的测序结果一般有一个峰图文件和一个序列文件,峰图文件为Abi格式,用chromas软件(网上可下载)打开.
四种颜色的波形代表四种碱基的信号强度;
测序结果的前几十bp不能用指的是下图中黄色区域标出的区域;
在拼接序列或序列比对时需要先去除这部分不太可靠的数据,以免影响分析结果;
在使用PCR产物测序时由于PCR引物上的碱基是不带染料的,所以检测不到信号,在测序结果中也找不到引物的序列,如连接到载体使用载体上的通用引物测序则可以找到PCR引物;