二面角指两个半平面所夹的空间部分。

残基二面角包括主链二面角和侧链二面角。主链二面角包括phi、 psi、 omega角，phi角是围绕着键N-Ca右手转动的角，当Ca-C键与C-N同向,则角度值为0；psi角是围绕着键Ca-C右手转动的角，当C-N键与N-Ca键同向，角度值为0；omega角是围绕着C-N键右手转动的角，当前一个残基的Ca-C键与N-Ca键同向，角度为0。大部分的残基含有两个多肽键。残基i和残基i+1形成的肽键分配到残基i+1，所以第一个残基没有二面角。

http://s1/mw690/001ZFeMBzy6Lwal98oo50&690

http://s11/mw690/001ZFeMBzy6LwaliVHI7a&690

侧链二面角包含chi1，chi2，chi3，chi4和chi5。每个侧链二面角需要四个原子的坐标。但是氨基酸没有相应的侧链二面角,ALA和GLY没有chi1，ALA，CYS，GLY，SER，TER和VAL无chi2角，仅ARG，GLN，GLU，LYS和MET有chi3角，仅ARG和LYS有chi4角，仅ARG有chi5角。

http://s11/mw690/001ZFeMBzy6Lwaldp58ca&690