UCSF chimera, ACPYPE, VMD的安装
| 分类: 分子模拟 |
UCSF chimera
默认的安装位置在"/opt/UCSF/"
"$install_bin_dir="/YOUR PATH/vmd/bin/;
$install_library_dir="/YOUR
PATH/vmd/lib/$install_name"
OR
using the default path in "/usr/local/lib/vmd/"
会在底下出现一行字,大意为按照 LINUXAMD64 OPENGL
FLTK TK ACTC IMD SPACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON
PTHREADS NUMPY SILENT等参数进行configure,所以在很多的install
guide中都有这么多的参数,其实在没有特殊的安装要求的情况下,可以不输入,按照default来。最重要的是红字的LINUXAMD64,即安装的系统格式,会出现为LINUX还是LINUXAMD64,全看下载的源文件是针对何种系统的。例如下图,vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz
1.
Download
2. sudo chmod +x
chimera-installer.bin
3.
./chimera-installer.bin
4.各种回车或者自己选择选项
ACPYPE
1. svn checkout
http://ccpn.svn.sourceforge.net/svnroot/ccpn/branches/stable/ccpn/python/acpype
acpype
2. cd acpype
3.
sudo ln
-s $PWD/acpype.py /usr/local/bin/acpype
OVER
VMD
1. Download
2. tar zxvf vmd-*.tar.gz
3. open the configure file, change the
path
4. ./configure
http://s13/mw690/001ZFeMBzy6H5DTxkhmcc&690chimera, ACPYPE, VMD的安装" TITLE="UCSF chimera, ACPYPE, VMD的安装" />
5. cd src
6. sudo make install
7. 装好后根据机器的环境,可能还需要安装csh、libstdc++5等库文件
7. 装好后根据机器的环境,可能还需要安装csh、libstdc++5等库文件
Enjoy!

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