加载中…
个人资料
  • 博客等级:
  • 博客积分:
  • 博客访问:
  • 关注人气:
  • 获赠金笔:0支
  • 赠出金笔:0支
  • 荣誉徽章:
正文 字体大小:

UCSF chimera, ACPYPE, VMD的安装

(2014-03-06 08:49:24)
分类: 分子模拟
UCSF chimera
1. Download
2. sudo chmod +x chimera-installer.bin
3. ./chimera-installer.bin
4.各种回车或者自己选择选项
  默认的安装位置在"/opt/UCSF/"

ACPYPE
1. svn checkout http://ccpn.svn.sourceforge.net/svnroot/ccpn/branches/stable/ccpn/python/acpype acpype
2. cd acpype
3. sudo ln -s $PWD/acpype.py /usr/local/bin/acpype
OVER

VMD
1. Download
2. tar zxvf vmd-*.tar.gz
3. open the configure file, change the path
    "$install_bin_dir="/YOUR PATH/vmd/bin/;
     $install_library_dir="/YOUR PATH/vmd/lib/$install_name"
   OR using the default path in "/usr/local/lib/vmd/"
4. ./configure
   会在底下出现一行字,大意为按照LINUXAMD64 OPENGL FLTK TK ACTC IMD SPACEBALL LIBTACHYON VRPN NETCDF TCL PYTHON PTHREADS NUMPY SILENT等参数进行configure,所以在很多的install guide中都有这么多的参数,其实在没有特殊的安装要求的情况下,可以不输入,按照default来。最重要的是红字的LINUXAMD64,即安装的系统格式,会出现为LINUX还是LINUXAMD64,全看下载的源文件是针对何种系统的。例如下图,vmd-1.9.1.bin.LINUXAMD64.opengl.tar.gz
http://s13/mw690/001ZFeMBzy6H5DTxkhmcc&690chimera, ACPYPE, VMD的安装" TITLE="UCSF chimera, ACPYPE, VMD的安装" />
5. cd src
6. sudo make install
7. 装好后根据机器的环境,可能还需要安装csh、libstdc++5等库文件
Enjoy!

0

阅读 收藏 喜欢 打印举报/Report
  

新浪BLOG意见反馈留言板 欢迎批评指正

新浪简介 | About Sina | 广告服务 | 联系我们 | 招聘信息 | 网站律师 | SINA English | 产品答疑

新浪公司 版权所有