最近，总有人明明养的是北种的石金钱龟却说自己的是南种石金钱龟的情况，可能其他龟友也或多或少遇见。我们姑且不论这是有意为之还是无心之失，或者也可能他根本也搞不清楚，错把北种当南种。那么，这里我们就务必搞清楚南北种两者之间的区别了，以免受骗上当。
　　头是最主要的区别部位。南种石金钱龟（以下简称南石）头一般为古铜色或灰黑色，越纯正的南石头上还有很明显的梅花斑。而北种石金钱龟（以下简称北石）一般头为青绿色，所以我们又称其为大青头，头上绝对不会有小黑点。还有的北石头部为黄金色，我们会称其为金头龟，南石是不会出现这样的情况的。
　　眼部来说，两者的区别也相当明显。南石会有一条黑色贯穿眼球，越明显证明南石的品种越纯正。而北石眼球中间没有这条黑线。南石的眼睛后面黄色纵纹旁会有两条较宽的黑线，而北石的黑线较细，基本看不出来。
　　外壳来说，南石的壳多为黄色、黑色或古铜色，跟金钱龟有点类似。北石的龟壳则多为黄绿色、绿色。壳上的缘盾，如果从上往下看，南石的背甲中部的缘盾可以清楚的看到，而北石的则基本看不到。
　　最后我们来看看腹甲。不论是南石还是北石，其腹甲上都有黑斑，区别就在于南石的班大而清晰且练成一线，北石的则较为细小，甚至有的没有。纯正南石的腹甲上的黑斑会前后相连成为一个弧形，看起来就是一个嘴唇的形状，很好辨认。
　　分别辨识了以上四个部位的特征，不光是可以轻易的区分出南石和北石，哪怕是杂交后的不纯种南石也能轻易识别出来了。