陈氏书院坐北朝南，主体建筑面宽、纵深均为80米，平面呈正方形，为中国“三进三路九堂两厢杪”院落式布局。

陈家祠由9座厅堂、6个院落、10座厢房和长廊巷组成，建筑面积达8000平方米。

陈家祠在建筑处理上，以中轴为主线，整体结构布局严谨、虚实相间，厅堂轩昂，庭院宽敞幽雅。