MNs血型之一---GYP基因分子生物学基础与基因分型的应用(上)

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GYP基因分子生物学基础与基因分型的应用
赵卫军(天津秀鹏生物技术开发有限公司)
MNS血型抗原是GPA基因或/和GPB基因的表达产物。 同时GPA表达M 或/和 N 抗原, GPB表达S或/和s抗原 GYPA与GYPB位于4号染色体的长臂,并且95%的序列相同,同时紧靠着不表达的GYPE的同源基因,即 GYPA-GYPB-GYPE结构,这样便给杂交基因的形成创造了机会。这些杂交基因的表达产物具有不同的抗原性。MNS系统包括大约有40多种抗原。这篇综述简要介绍GYP基因分子生物学基础,特别是杂交基因的表达产物分子生物学基础。
关键词:MNS血型系统,,分子基础
表一
抗原 |
曾用名 |
抗原 |
曾用名 |
抗原 |
曾用名 |
M |
|
Cla |
Caldwell |
TSEN |
|
N |
|
Nya |
Nyberg |
MINY |
|
S |
|
Hut |
Hutchinson |
MUT |
|
s |
|
Hil |
Hill |
SAT |
|
U |
|
Mv |
Armstrong |
ERIK |
|
He |
Henshaw |
Far |
Kam |
Osa |
|
Mia |
Miltenberger |
sD |
Dreyer |
ENEP |
|
Mc |
|
Mit |
Mitchell |
ENEH |
|
Vw |
Gr,Verweyst |
Dantu |
|
HAG |
|
Mur |
Murrell |
Hop |
Hopper |
ENAV |
AVIS |
Mg |
Gilfeather |
Nob |
Noble |
MARS |
|
Vr |
Verdegaal |
Ena |
|
ENDA |
High – GPA-B-A |
Me |
|
ENKT |
EnaKT |
ENEV |
High – V62G |
Mta |
Martin |
‘N‘ |
|
MNTD |
Low – T17R |
Sta |
Stones |
Or |
Orriss |
|
|
Ria |
Ridley |
DANE |
|
|
|
表二
产生机制 |
相关抗原 |
单核苷酸突变 |
GPA:Vr, Mta, Ria, Nya, Or, ERIK,Osa, ENEP/HAG, ENAV/MARS GPB: S/s,Mv, sD, Mit |
两个或多个核苷酸突变 |
M/N |
基因不等位交换 |
Sta, Dantu, Hil,TSEN, MINY, SAT |
基因转换 |
He,Mia,Vw/Hut/ENEH,Mur,Mg,Mc,Sta,Hil,Hop, Nop,DANE,MINY,MUT |
1
3 GYP抗原多态性的机制
GYP抗原多态性机制主要有单核苷酸突变,两个或多个核苷酸突变,外显子的缺失,基因不等位交换,基因转换。编码细胞膜表面的氨基酸序列的碱基发生突变会形成特殊的抗原表型。GYP多态性抗原其分子机制详见表3。
表三、GYP多态性抗原的分子机制
类别 |
分子机制 |
类别 |
分子机制 |
GYP Dantu |
GYP B-A 杂交基因 |
GYPAdel |
GYPA exon 2-7缺失 |
GYP Erik/Sta |
GYPA |
GYPB (NY) |
208G>T; 230C>T; 251C>G |
GYP Mit |
GYPB 161G>A |
GYPB (P2) |
intron 5 5G>T |
GYP Sat |
GYPA-BS 杂交基因 |
GYPB del |
GYPA exon 2-6缺失 |
GYP Sta |
GYP B-A 杂交基因 |
GYPB M(V) |
65C>G |
GYP |
GYP A-E-A 杂交基因 |
GYPB s(D) |
173C>G |
GYP StaD |
GYPA-B杂交基因 |
GYPHe (GL) |
GYPB-A-B 杂交基因 |
GYP StaMz |
GYPA-B-A hybrid杂交基因 |
GYPHe (Henshaw) |
GYPB-A-B 杂交基因 |
GYP Vr |
197C>A |
GYPHe (NY) |
GYP B-A-B杂交基因 |
GYPA ENEV |
242T>G |
GYPHe P2 |
GYP B-A-B 杂交基因 |
GYPA HAG |
250G>C |
GYPHe/Sta |
GYP B-A-B-A杂交基因 |
GYPA Mc |
GYPA-B-A杂交基因 |
GYPA Mta |
230 C>T |
GYPA Mg |
GYPA-B-A杂交基因 |
GYPA Nya |
138T>A |
GYPA Osa |
217C>T |
|
|
3.1
GYPA 基因的外显子2-7缺失与GYPB基因的外显子1缺失将产生En(a–)Fin表型7,8。 GYPB 基因的外显子2-7缺失与GYPE基因的外显子1缺失将产生S–,s–,U –表型9,GYPA 基因的外显子2-7缺失,GYPB基因的外显子1-6缺失,GYPE基因的外显子1缺失将产生MkMk表型4,10。MkMk的个体缺乏所有的GYPA与GYPBA 的抗原。
3.2
许多MNS系统的抗原是由单核苷酸突变造成。见表三。
表三
抗原 |
外显子 |
单核苷酸突变 |
氨基酸突变 |
GPA |
|||
ENEH/Vw/Hut |
3 |
140C>T>A |
Thr28Met/Lys |
Vr |
3 |
197C>A |
Ser47Tyr |
Mta |
3 |
230C>T |
Thr58Ile |
Ria |
3 |
226G>A |
Glu57Lys |
Nya |
3 |
138T>A |
Asp27Glu |
Or |
3 |
148C>T |
Arg31Trp |
ERIK |
4 |
232G>A |
Gly59Arg |
Osa |
3 |
217C>T |
Pro54Ser |
ENEP/HAG |
4 |
250G>C |
Ala65Pro |
ENAV/MARS |
4 |
244C>A |
Glu63Lys |
GPB |
|||
S/s |
4 |
143T>C |
Met29Thr |
Mv |
2 |
65C>G |
Thr3Ser |
sD |
4 |
173C>G |
Pro39Arg |
Mit |
4 |
161G>A |
Arg35His |
3.3 基因不等位交换,基因转换
GYPA, GYPB, GYPE有95%的序列相同,长度为150 kb ,在染色体以5‘GYPA-GYPB-GYPE-3‘形式排列。GYPE 基因并不参与膜蛋白编码但参与基因的重排形成许多杂交基因。GYPA, GYPB, GYPE 的同源性使得基因不等位交换,基因转换发生频率较高7,11。基因不等位交换是由于在减数分裂中同源基因的不同位核苷酸发生相互交换的过程。一条染色体可能形成GYPA-B杂交基因,同时另一条染色体可能形成GYP(B-A)。基因转换是由于在减数分裂中同源基因基因修复过程中形成的.7,12。基因转换能引起GYPA基因中的部分插入核苷酸GYPB中,也会出现GYPB基因中的部分插入核苷酸GYPA中。因此某些个体的两条染色体会出现一条为GYP(B-A-B) 另一条为GYPA。反之一样。这样的基因变异也会使本来并不表达的GYPB的第三外显子假基因进行转录表达,例如Miltenberger 血型7,见图二。