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MNs血型之一---GYP基因分子生物学基础与基因分型的应用(上)

(2011-03-21 11:12:04)
标签:

健康

分类: 基础知识文章

GYP基因分子生物学基础与基因分型的应用

赵卫军(天津秀鹏生物技术开发有限公司)

MNS血型抗原是GPA基因或/GPB基因的表达产物。 同时GPA表达M / N 抗原, GPB表达S/s抗原 GYPAGYPB位于4号染色体的长臂,并且95%的序列相同,同时紧靠着不表达的GYPE的同源基因,即 GYPA-GYPB-GYPE结构,这样便给杂交基因的形成创造了机会。这些杂交基因的表达产物具有不同的抗原性。MNS系统包括大约有40多种抗原。这篇综述简要介绍GYP基因分子生物学基础,特别是杂交基因的表达产物分子生物学基础。

关键词:MNS血型系统,,分子基础

     MNS血型系统是第二个被发现的血型系统1,目前MNS血型系统大约包括40多个抗原,其复杂程度仅次于RH系统2MNS血型系统基因多态性的产生机制主要有单核苷酸突变,基因不等位交换,基因转换(见表一,表二)。

表一  MNS血型系统抗原

抗原

曾用名

抗原

曾用名

抗原

曾用名

M

 

Cla

Caldwell

TSEN

 

N

 

Nya

Nyberg

MINY

 

S

 

Hut

Hutchinson

MUT

 

s

 

Hil

Hill

SAT

 

U

 

Mv

Armstrong

ERIK

 

He

Henshaw

Far

Kam

Osa

 

Mia

Miltenberger

sD

Dreyer

ENEP

 

Mc

 

Mit

Mitchell

ENEH

 

Vw

Gr,Verweyst

Dantu

 

HAG

 

Mur

Murrell

Hop

Hopper

ENAV

AVIS

Mg

Gilfeather

Nob

Noble

MARS

 

Vr

Verdegaal

Ena

 

ENDA

High – GPA-B-A

Me

 

ENKT

EnaKT

ENEV

High – V62G

Mta

Martin

N

 

MNTD

Low – T17R

Sta

Stones

Or

Orriss

 

 

Ria

Ridley

DANE

 

 

 

表二   MNS血型系统基因多态性的产生机制

产生机制

相关抗原

单核苷酸突变

GPA:Vr, Mta, Ria, Nya, Or, ERIK,Osa, ENEP/HAG, ENAV/MARS

GPB: S/s,Mv, sD, Mit

两个或多个核苷酸突变

M/N

基因不等位交换

Sta, Dantu, Hil,TSEN, MINY, SAT

基因转换

He,Mia,Vw/Hut/ENEH,Mur,Mg,Mc,Sta,Hil,Hop, Nop,DANE,MINY,MUT

 

1  GYP 基因组

 这个基因组包括GPA (GYPA)GPB (GYPB)GYPEGYPE 并不编码蛋白但其参与基因杂交的形成。GYPA6个外显子,GYPB6个外显子,但第3外显子为假基因不参与编码3-6,外显子1与部分外显子2为先导序列,外显子2-4编码膜外蛋白,外显子5编码穿膜蛋白,外显子6编码胞浆蛋白,见图一。

 

 

3 GYP抗原多态性的机制

GYP抗原多态性机制主要有单核苷酸突变,两个或多个核苷酸突变,外显子的缺失,基因不等位交换,基因转换。编码细胞膜表面的氨基酸序列的碱基发生突变会形成特殊的抗原表型GYP多态性抗原其分子机制详见表3

表三、GYP多态性抗原的分子机制

类别

分子机制

类别

分子机制

GYP Dantu

GYP B-A 杂交基因

GYPAdel

GYPA exon 2-7缺失

GYP Erik/Sta

GYPA  232G>A

GYPB (NY)

208G>T; 230C>T; 251C>G

GYP Mit

GYPB 161G>A

GYPB (P2)

intron 5 5G>T

GYP Sat

GYPA-BS 杂交基因

GYPB del

GYPA exon 2-6缺失

GYP Sta

GYP B-A 杂交基因

GYPB M(V)

65C>G

GYP

GYP A-E-A 杂交基因

GYPB s(D)

173C>G

GYP StaD

GYPA-B杂交基因

GYPHe (GL)

GYPB-A-B 杂交基因

GYP StaMz

GYPA-B-A hybrid杂交基因

GYPHe (Henshaw)

GYPB-A-B 杂交基因

GYP Vr

197C>A

GYPHe (NY)

GYP B-A-B杂交基因

GYPA ENEV

242T>G

GYPHe P2

GYP B-A-B 杂交基因

GYPA HAG

250G>C

GYPHe/Sta

GYP B-A-B-A杂交基因

GYPA Mc

GYPA-B-A杂交基因

GYPA Mta

230 C>T

GYPA Mg

GYPA-B-A杂交基因

GYPA Nya

138T>A

GYPA Osa

217C>T

 

 

3.1  GYP基因外显子缺失引起null表型

GYPA 基因的外显子2-7缺失与GYPB基因的外显子1缺失将产生En(a–)Fin表型7,8 GYPB 基因的外显子2-7缺失与GYPE基因的外显子1缺失将产生S–s–U –表型9GYPA 基因的外显子2-7缺失,GYPB基因的外显子1-6缺失,GYPE基因的外显子1缺失将产生MkMk表型4,10MkMk的个体缺乏所有的GYPAGYPBA 的抗原。

3.2  单核苷酸突变

许多MNS系统的抗原是由单核苷酸突变造成。见表三。

表三  单核苷酸突变造成引起的MNS抗原变异体

抗原

外显子

单核苷酸突变

氨基酸突变

GPA

ENEH/Vw/Hut 

3

140C>T>A

Thr28Met/Lys

Vr 

3

197C>A

Ser47Tyr

Mta 

3

230C>T

Thr58Ile

Ria

3

226G>A

Glu57Lys

Nya  

3

138T>A

Asp27Glu

Or

3

148C>T

Arg31Trp

ERIK

4

232G>A

Gly59Arg

Osa

3

217C>T

Pro54Ser

ENEP/HAG 

4

250G>C

Ala65Pro

ENAV/MARS

4

244C>A

Glu63Lys

GPB

S/s

4

143T>C

Met29Thr

Mv 

2

65C>G

Thr3Ser

sD 

4

173C>G

Pro39Arg

Mit 

4

161G>A

Arg35His

 

3.3 基因不等位交换,基因转换

GYPA, GYPB, GYPE95%的序列相同,长度为150 kb ,在染色体以5GYPA-GYPB-GYPE-3‘形式排列。GYPE 基因并不参与膜蛋白编码但参与基因的重排形成许多杂交基因。GYPA, GYPB, GYPE 的同源性使得基因不等位交换,基因转换发生频率较高7,11基因不等位交换是由于在减数分裂中同源基因的不同位核苷酸发生相互交换的过程。一条染色体可能形成GYPA-B杂交基因,同时另一条染色体可能形成GYP(B-A)基因转换是由于在减数分裂中同源基因基因修复过程中形成的.7,12基因转换能引起GYPA基因中的部分插入核苷酸GYPB中,也会出现GYPB基因中的部分插入核苷酸GYPA中。因此某些个体的两条染色体会出现一条为GYP(B-A-B) 另一条为GYPA。反之一样。这样的基因变异也会使本来并不表达的GYPB的第三外显子假基因进行转录表达,例如Miltenberger 血型7,见图二

 

 2  GYPAGYPB不等位交换与基因转换

http://s16/middle/6a23d1c3g9ef59cc22d1f&690

N

0

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