20种氨基酸,看完这篇文章你就熟悉了!
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大学时背的是氨基酸的三字母表示法,因为生化书上多半是用三字母表示的。可是随着生物信息学的发展,看单字母的时候越来越多了,偏偏单字母和三字母的字头又不一致,常常搞混,于是我采用联想记忆法,效果不错,拿出来和大家分享一下: 我们只来记那些和三字母表示法不一致的这些:
苯丙氨酸: 笨——Fool……F
赖氨酸: 赖皮——砍(Kan)他……K
精氨酸:精子——人(Ren)……R
色氨酸:色狼——Wolf……W
酪氨酸:奶酪——黄色(Yellow)……Y
天冬氨酸:天——地(Di)……D
谷氨酸: 谷子里面有很多酶——Enzyme……E
天冬酰胺:Asn……N
谷氨酰胺:Gln,虽然也是n, 无奈总排在“天冬”的后面,只好整个不一样的Q
Asp/Asn:两个A加一块=
Glu/Gln:
另外,我要说的是疏水性与氨基酸的侧链有关,AA可分为脂肪族,芳香族,极性带电荷和极性不带电荷四种。前两种非极性,疏水性强;后两种极性还可能形成氢键,亲水;
①非极性、疏水性氨基酸(脂肪族/芳香族):甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸和脯氨酸。
②极性、中性氨基酸(亲水性):色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺和苏氨酸。
③酸性的氨基酸(还有多个COOH基团):天冬氨酸和谷氨酸。
④碱性氨基酸(含有多个-NH2基团):赖氨酸、精氨酸和组氨酸。
http://s3/middle/6850a808g903439b57fa2&690
http://s11/middle/6850a808g90346bd84c4a&690
http://s7/middle/6850a808g90346cd24a66&690
20种氨基酸的疏水参数见下面(越-表示亲水性越强):
Arg(R) -4.5
Lys(K) -3.9
Asn(N) -3.5
Asp(D) -3.5
Gln(Q) -3.5
Glu(E) -3.5
His(H) -3.2
Pro(P) -1.6
Tyr(Y) -1.3
Trp(W) -0.9
Ser(S) -0.8
Thr(T) -0.7
Gly(G) -0.4
Ala(A) 1.8
Met(M) 1.9
Cys(C) 2.5
Phe(F) 2.8
Leu(L) 3.8
Val(V) 4.2
Ile(I) 4.5

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