近代科学与哲学作为不同的学科，有着各自不同的范式规范或要求。近代科学主要采用还原论的方法认识事物，而哲学则主要运用普遍联系的方法认识事物。近代科学的研究对象是看得见、摸得着的实体物质，而哲学探索的则是看不见、摸不着的事物的内因或本质。这两种范式既不能互相僭越，也不能相互替代、相互否定。当然，由于其认识事物的范式不同，结论自然也各不相同。我们应该承认哲学与近代科学不同范式下的不同结论，而不是以一种结论否定另外一种结论。比如，对人的认识近代科学主要采用还原论的方法对实体性的形体（包括脑）进行层层解剖层层分析，而哲学则采用普遍联系的方法追问非实体性的人的内因或本质即心的问题，不能由于近代科学研究的实体脑看得见、摸得着而否认哲学上的看不见、摸不着的非实体的人的内因或本质即心是真实存在。