精神辩证法认为中国传统文化中的“心”其实就是人体内部联系形成的内因或本质的代名词，“心”作为人的内因或本质不是实体性的，但看不见、摸不着的“心”具有意识、思维功能，而且能够向下指挥、控制人的形体。脑是个看得见、摸得着的实体器官，没有逻辑可以说明看得见、摸得着实体脑是人的内因或本质。做人主要是修心的问题而不是修脑的问题。既然脑不是人的内因或本质，脑在地位上如何能够高于“心”并控制“心”？精神辩证法认为“心”是在以脑为主的实体器官基础上突现形成的高层次系统，是这个高层次系统具有意识、思维功能并向下支配、控制其他系统（包括脑）的。