1. 段誉的梦中情人名为王玉燕；
2. 段誉老妈的名字本为舒白凤；
3. 段誉所学的神功为“朱蛤神功”；
4. 天山童姥的返老还童功是“天上地下唯我独尊功”；
5. 大理段正淳身边四大护卫的名字是：凌千里，萧笃诚，董思归和朱丹臣；
6. 游坦之在丐帮的名字是王星天；
7. 西夏一品堂杏子林中迷倒丐帮大众的药是“红花香雾”；
8. 刚开始时，钟灵有两条灵蛇；
9. 哲罗星曾经坐着两条大蟒蛇从天竺来到中原；
10. 段誉曾在杏林子中用其“朱蛤神功”与游坦之的“冰蚕神功”对掌，一时难分胜负；
11. 慕容复出场时曾与叶二娘交战。

1. 王语嫣的外公，从无崖子变成了丁春秋；
2. 皇宫中的王语嫣担心年华老去、青春不在，为了永保“神仙容貌” ，决定跟丁春秋修习驻颜术却不幸失败。并因此无面目回到段誉身边，而暗示其最终投入慕容复的怀抱；（我勒个去，一直以为这是同人的谣传，居然是真的！！！）
3. 虚竹因为“抢了西夏公主而不好意思”，便把梅兰竹菊连同西夏公主的婢女一并送给段誉，而木婉清、钟灵也住到皇宫中，加上阿碧，八名美女陪着段誉住在皇宫里；（有借有还是么？http://www/uc/myshow/blog/misc/gif/E___6710EN00SIGG.gif）
4. 为符合史实段誉最终还是出家为僧；
5. 乔峰修改“降龙十八掌”为“降龙廿八掌”；
6. 天山童姥的返老还童功叫天长地久不老长春功。（还是“八荒六合唯我独尊”更霸气）
7. 游坦之所练经书由《易筋经》变为《神足经》；
8. 鸠摩智从丁春秋处盗取了7本《小无相功》秘籍，修炼后功力大增，并以之运使少林七十二绝技。

1. 由郭啸天、杨铁心唱的满江红开头；
2. 杨过的母亲是穆念慈；
3. 黄药师并未练过《九阴真经》；
4. 杨康是被黄蓉软猬甲之毒所杀；
5. 欧阳锋在冰中时间改为三个时辰；
6. 裘千仞练的是铁砂掌；
7. 洪七公刚开始教黄蓉的是“蟠龙棍”。

1. 以张十五说书作为本书的开场；
2. 多了曲灵风盗宝及与郭杨二人的对话；
3. 将秦南琴与穆念慈合二为一；
4. 增加了黄裳撰写《九阴真经》的经过；
5. 将欧阳锋困在冰柱中的时间改为一个时辰；
6. 加上了黄蓉迫人抬轿与长岭遇雨两段情节；
7. 裘千仞的看家本领变成了“铁掌神功”，手上无毒。

1. 详细说明了《九阴真经》原始本、首抄本、二抄本的来龙去脉；
2. 深入描绘了黄药师与梅超风之间的一段若有似无的暧昧情愫；
3. 合理解释了“蛤蟆功”的潜在威力；
4. 书的结尾处，郭靖与黄蓉镇守的襄阳城变成了青州城；
5. 九阴神抓、摧心掌、四仗长鞭原为《九阴真经》中的光明正大武学，这回变成了黄裳专要破的阴毒武功；
6. 将“九阴神抓”、“四仗长鞭”改为“摧坚神抓” 、“白蟒鞭”；
7. 对九阴作出解释，按易经，阳为奇数，阴为偶数，所以《九阴真经》的最高境界应为阴阳相容、刚柔相济；
8. 《九阴真经》的“篇”改为“章”；
9. 陈玄风并未把九阴真经刻在胸前。针对有读者提出疑问：陈玄风如何能将一部洋洋万言的九阴真经刺在自己不足一平方米的胸膛？修订版删除了陈玄风“刺经于胸”这一情节，改为“陈玄风临死前将真经下卷抄本塞在妻子怀里”；
10. 九阴真经的下卷末多了梅超风的一行话；
11. 对降龙十八掌做了更多更完善的说明补充，“鱼跃于渊”和“战龙在野”，皆以“或跃在渊”和“龙战于野”称呼；
12. 稍微交代了乔峰改降龙十八掌的过程，原来“神龙摆尾”来自虚竹的“履虎尾”；
13. 傻姑提前登场（郭啸天杨铁心时代）；
14. 马钰“三花盖顶掌法”改成“履霜破冰掌法”；
15. 特别在每个章回末或多或少的增加了一些注释（主要是对一些评论观点的反驳）。例如网友所论的“宋代才女唱元曲”、“守宫砂是否真有其事”、“蒙古军队如何有汉人大将”……等。
16. 合理解决了靖蓉的年龄问题。

1. 魔教长老为五岳剑派所困。
2. 莫大逃过大难，还出现在令狐冲与任盈盈的婚礼上；

1. 将尹志平一化为二，玷污小龙女的角色改为虚构人物“甄志丙”；
2. 第六回中，大幅补写小龙女和杨过在古墓中修炼《玉女心经》的过程，龙杨二人习练后由此产生心情变化，杨过情不自禁欲吻小龙女；
3. 增补李莫愁对小龙女说出当年陆展元如何抛弃她的言语；
4. 解释了郭靖黄蓉夫妇何以对穆念慈母子不闻不问、何以对投入全真教的杨过不闻不问；
5. 大幅度增加杨过与小龙女谈情说爱的对话场面。小龙女在新补稿中不再冷若冰霜，对杨过更加热情、更爱撒娇，喜乐不禁；
6. 以长达数页的篇幅，批注本书的中心主轴“师生恋”；
7. 将西藏金轮法王改为蒙古金轮国师；
8. 增补郭襄与金轮国师之间的互动：如在蒙古军中，国师如何待之如亲女，疼爱有加；郭襄也正式拜国师为师，学习瑜伽密乘；国师见郭襄跳崖，伤心落泪；国师本不忍将郭襄绑赴高台，最终舍命救了郭襄。大幅改变金轮国师对郭襄的态度，也改变了国师的结局；
9. 郭襄把自己想象成了大龙女，并幻想如果是自己和杨过第一次见面而不是小龙女，那么杨过一定会爱上她的。以后还有襄暗中和小龙女“较量”的情节。（哎，可爱的襄儿也变俗了）
10. 还有，对情感戏的重大调整：

新版《神雕侠侣》对杨过与小龙女之间的一些重要情感戏做了比较大的修改，并以长达数页篇幅，批注本书的中心主轴“师生恋”。

例如，旧版中，杨过与小龙女在古墓的生活始终“守之以礼”。新版里，金庸安排杨过在梦中练捕麻雀、蝴蝶的“柔网式”（旧版中为“天罗地网式”），在练习的过程中，杨过手中抓到一只蝴蝶，他猛然惊醒，发现手中握的竟是小龙女的玉足。这是两个人的“第一次亲密接触”。

这之后是“玉女心经”一章。旧版中，两人出了古墓、迎战金轮法王时，才悟到合使玉女剑法和全真剑法的诀窍。新版中，两人在古墓中便参透《玉女心经》，并练起“双剑合璧”，因此感情大增。金庸还新创一招“亭亭如盖”，安排杨过练习时，双手紧紧抱住小龙女，看到小龙女娇艳欲滴的樱唇，忍不住低头欲吻。

再其后是杨过与小龙女在英雄大会久别重逢的那一段，金庸在旧版中只形容两人坐在台下“喁喁细语”，新版中则仔细描述“细语”内容。这些对话显得相当直接。

小龙女问杨过：“你一天想我几次？”杨过说：“一天至少想两百次。”小龙女道：“两百次不够，我要三百次。”杨过说：“我一天想你四百次，上午两百次，下午又两百次。”小龙女接着道：“你吃饭时也想我，就多一百次，一天想五百次。”这样一直算下去，到最后杨过一天必须想小龙女一千次。（真他娘的贫！又不是高考作文，在这儿凑哪门子字数。。。http://www/uc/myshow/blog/misc/gif/E___7395ZH00SIGG.gif）

除此之外，旧版中杨过对妙龄美女皆嬉皮笑脸，惟独对红粉知己程英敬重有加。但在新版里他对程英也恢复“浪子”本性，称她为“姑姑”（因为程英是黄蓉的师妹）。而金庸形容老成持重的程英表面生气，却是暗喜不已。至于郭芙对杨过若有似无的情愫，新版中保持原状，还是点到为止。