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http://qinqianshan.com/need-to-be-true-false-values-can-not-be-used-for-missing/#more-196

> for (i in 1:nrow(d)){if (d$phylum[i]=="Cyanobacteria") {d$tax.color[i]<-100}}

错误于if (d$phylum[i] == "Cyanobacteria") { :

  需要TRUE/FALSE值的地方不可以用缺少值

原因：

if得到的必须是TRUE/FALSE，我得到了NA

d$phylum=="Cyanobacteria"  发现出来的结果有FALSE,有TRUE，有NA,一检查果真是有空白值

解决办法：

d$phylum[is.na(d$phylum)]<-0

> for (i in 1:nrow(d)){if (d$phylum[i]=="Cyanobacteria") {d$tax.color[i]<-100}}

for (i in 1:nrow(d)){if (d$phylum[i]==0) {d$phylum[i]<-NA}};

参考资料：

http://f.dataguru.cn/thread-480-1-1.html