【T】求解-微生物比生长速率(代时)
(2014-02-28 22:45:02)
标签:
比生长速率计算杂谈 |
分类: 生物常见的一些概念及方法 |
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1,我这里用CH4的含量变化来反映菌体浓度的变化,所以CH4代表微生物的相对值,对CH4的log化,相当于上面公式lgx.在excel表格中,如果0.76951所在的位置为B4,那么-0.262可以通过输入LN(B4)求得,然后一拉,下面都会生成。
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CH4 | LN(CH4) |
2 | 0.76951 | -0.262 |
3 | 1.33659 | 0.290122 |
4 | 2.23758 | 0.805395 |
5 | 3.25495 | 1.180177 |
7 | 5.02794 | 1.61501 |
9 | 6.83449 | 1.921982 |
10 | 7.45708 | 2.009164 |
(lgx2-lgx1)/ (t2-t1)
选择的点除了要让斜率大以外,相关性也要好。选择做出来的那条线,单击右键,设置趋势线格式,添加R,显示公式.R反映的是你的点相关性,越接近1,数据越好,而显示公式上面的斜率即为所得
3上面作图得到的斜率除以ln(2),即为比生长速率,注意单位
误差线的添加
实际我们同一个样品会有好几组平行实验,那怎么加入误差线呢,我现在做的就是对每个平行样分别求出每个样品的比生长速率,然后AVERAGE(1,2,3),STDEV(1,2,3)即可。
ps;上面仅仅提供了通过excel表格的一个解决方案,还有很多地方,比如说这个求方差就比较麻烦,需要对每个点求值,然后再来统计,可不可以优化一下呢。
我之前思考能不能通过R语言直接来统计,后来发现也不靠谱哦,但是ORIGIN是可以做到的,具体怎么做,我也就没去研究罗。