明治七年（1874年），明治政府委托大久保和大偎调查研究侵略台湾和朝鲜事宜，二人提出九条《台湾‘蕃’地征伐要略》，其核心内容是，台湾“土蕃”乃清政府政令所不及的无主地，出兵并不侵犯中国主权。明治政府很快批准这个“要略”，命陆军大辅西乡从道率领3600名士兵，于5月22日，向高山族展开全面进攻，遭到台湾人民的坚决抵抗。后在英、法的调解下，清政府赔偿50万两白银，签订《北京专条》，明确写上日本侵略台湾是“保民义举”，“中国不指以为不是”，给以后的中日关系留下了无穷后患。这是在明治维新后，中日两国在近代关系史上的第一次对事件发生后的交涉，以中国失败和日本胜利而告结束，使得日本初尝用武力侵略中国的甜头。

   明治政府通过侵台事件，已知清政府软弱无能，遂准备把侵吞中国周边属国，作为实现其大陆政策的第一步，而琉球是其最先侵略的目标之一。大久保在北京与李鸿章交涉处理侵台事件时，便考虑好如何处理琉球问题。回日本后，他向明治政府建议，尽快结束“琉球两属形态”，“断其与中国之关系”，“以举其我版图之实效”，明治政府采纳了他的意见，于明治八年（公元1875年）派兵去琉球，命令撤销在福州的琉球馆，贸易划归厦门日本领事馆管辖，禁止向清政府进贡及参加祝贺清帝光绪即位典礼和接受清帝册封。明治九年（1876年），日本强行接管琉球的司法与警察权，琉球王国已经名存实亡。

   琉球国王不甘心国家的灭亡，派其国舅赴福州，述说日本吞并其国，乞求助其复国。琉球在日官吏也向中国驻日公使作了同样的申诉，但清政府特别是李鸿章根本不愿意为琉球独立承担风险与日本交涉。后在美国人的调停下，提出两分琉球的方案，即把琉球南部宫古、八重山两个岛屿让与中国，中部、北部的34个岛屿归日本。但琉球共分北、中、南三个岛群共36个岛屿，以南部岛群最贫瘠，并且不能自立。后来，中国提出三分法方案，即北部岛群归日本，中部岛群复琉球国，南部岛群归中国，日本不同意。后来由于日本开始向朝鲜扩张，中日双方都被朝鲜问题吸引过去，琉球问题此后不再提起，实际上，清朝政府已经默认日本对琉球的吞并了。综上所说：琉球岛至今没有任何协议，完全是日本肆意妄为吞并的。