在一个偏僻的村子生活着年幼的勇者。一日，死亡比萨罗为了杀害勇者攻击了这个村子，除躲在地下室的勇者幸免于难外，其他人都遭到了不策。勇者知道自己的身份后带着他自己与生具来的使命开始了与邪恶做斗争。
离开已经成为废墟的村子，去布兰卡城，在这里遇见了一组冒险的队伍。想想自己单凭自己一个人的力量是消灭不了邪恶的于是想加如他们的队伍，可是他们的人数满了。自己只能去找其他的冒险家。在城中听说，米雷亚和玛妮雅两姐妹在恩多耳城占卜。为什么不去找找她们看看她们是否愿意。通过杜鲁尼可开凿出来的隧道到达了恩多耳城，找找了两姐妹问他们是否愿意和自己一起去对抗邪恶。想不到她们两姐妹也在寻找自己，也同样需要自己的力量。于是两姐妹结束了她们的占卜。
在布兰卡城的东边沙漠附近的房子里面有马车，要想过沙漠，则必须借助马车。勇者向马车的主人借，可是因为他曾经被人骗过后就不在信任任何人。听说在东面的洞穴里面有信任之心，或许这个对自己有帮助，为了借到马车，前往东边的洞穴找寻信任之心。小心里面的陷阱，在3B的石头中找到信任之心。带着信任之心去找马车的主人——霍夫曼，他便会吧马车借给勇者，同时自己也加入到了勇者队伍当中。
坐马车到南边的达亚乃鲁，在这里听不到重要的情报。继续向南前进。到达港都柯南贝利，可以打听到
1安莉娜一行人曾经来过这
2第三章的主角杜鲁尼可去了东边的灯塔
先去灯塔找杜鲁尼可。见面后，杜鲁尼可拜托勇者一行人消灭灯塔中的妖怪，解除邪恶之光。到4F找到圣火种解决了5F的BOSS，对着火瓶使用圣火种，邪恶之光消失。回柯南贝星见杜鲁尼可，他也加入了队伍，同时得到了船。有了它可以航行与世界各地，开始找寻下一个目标——安莉娜一行人。
从港都柯南贝利向南航行，到达多士镇。先到旅馆中见到了布莱和克里夫多，次时的克里夫多得了怪病，而安莉娜则为他找药去了。和布莱对话让他加入队伍，帮助他去寻找药草——帕提奇亚。在找到希尔丹和他对话选择“不”便可得到世界地图。
去东南方的国家苏列达寻找药草帕提奇亚。来了才发现药草帕提奇亚灭绝了，连国王都穷到下地种田的地步（游戏中所以的国家似乎都很穷）。不郭天无绝人之路。国王告诉勇者，在南部的洞穴里面还存在着帕提奇亚的种子。进入洞穴在2B见到了安莉娜公主，她和另外一队人在一起。那队人咋看起来跟眼熟，原来就是布兰卡城的那队人。勇者比他们先在B3找到了帕提奇亚的种子，把他带回去给国王，得到奇亚的根。拿他回去给克里夫多使用，此时安莉娜已经回到了旅馆。克里夫多的病康复后，安莉娜和他加入了勇者的队伍.
大伙正要离开旅馆的时候，服务员告诉勇者，莱安在找他。得到消息的勇者一行人前往金雷欧城，这时霍夫曼说要继承父业，留在了多士镇，在这里经营旅馆的生意。
勇者一行人到达金雷欧城，没有魔法钥匙根本进不了城。跑到上方城市哈巴里亚问武器店老板，得到在科密兹村的炼金术师会做魔法钥匙的情报。到下方的科密兹村和炼金术师恩多加家中的史来姆对话，通过它的指引，前往西边的洞穴，在B3调查一下空宝箱出现一个楼梯，在底下密室中找到魔法钥匙。带着魔法钥匙回金雷欧城，用它把大门打开，在城中找到战士莱安，与他合力消灭城中国王金雷欧。在找到大臣对话。得知仇人巴鲁萨克在山多海姆城做了国王。迅速乘船想西北航行至山多海姆城把仇人巴鲁萨克消灭，随后在城中找到了神奇笛子和岩杖。
在山多海姆城的北方有个叫史丹夏拉的国家,那里的国王成天处于忧郁之中,他发布公告:只要谁能使他笑,便可以得到任何东西.听说有这等好事为什么不去呢?
于是前往史丹夏拉,去逗国王笑,可是失败了.在城中听说帕农可能会使国王发笑.于是又到蒙巴巴拉请来了帕农,然而帕农也没有使国王笑起来,但是帕农说出了国王的心病之所在和解决之方法,勇者终于在国王处得到了天空之盔.
离开史丹夏拉.从海面向东航行,进入巴多兰多国境,晚上去伊姆鲁村旅馆休息.竟然做了一个很真实的梦.梦醒后,勇者到巴多兰多城向国王要天空之盾,国王却说他把天空之盾送给了加登堡女王了.
加登堡城在巴多兰多城的东边,用岩杖把山道上的石头劈开,便可顺利到达.在城中四处打听一下,不料被人陷害,还被关进大牢.幸得女王人好,给了一次机会让勇者亲手去抓真正的犯人.在城郊外下方的洞穴B3中找到了真正的犯人,并把他抓获.回去向女王复命.得到最后之匙,用它打开拥有天空之盾的门,顺利得到了天空之盾.
出了加登堡城继续向东前进到达一个叫罗莎希尔村的地方,这个地方和以前在伊姆鲁村所做的梦的梦中场景一模一样.使用梦中的方法打开高塔的暗道,进入后消灭一个BOSS,和里面的史莱姆对话,打听到在恩多尔城的西南面的王族墓里面有变身杖.
先别急着去那里,到罗莎希尔村上方的瀑布看看,似乎有个暗道.
乘船到山多海姆城下方的海边小镇,晚上在水中可以看见一块漂浮在水面上的沙地(不知道的时候,我还以为是BUG),白天在那块沙地上调查一下得到浮木石.迅速回到罗莎希尔村上方的瀑布,在特定位置使用浮木石,方可进入瀑布内部.在瀑布里面可以得到金属剑和沙漏.
得到了所有物品,前往恩多尔城西南的王族墓.B1可以得到变身杖,另外B3还有个魔导士杖.终于得到了变身杖,准备前往妖精之城.
从布兰卡城向下航行到达河之村.在进入附近的小庙中的巨大神像体内,到6F把杠杆开启,神像会移动到水的另一面,登陆岸上可以看见妖精之城,在进入前先使用变身杖把自己变成妖精,在进去.从妖精处打听一些情报后就去2F开会.开完会直接去阿提姆多的矿山中,由B4进入一个地下神殿,在地下神殿3F遇上BOSS,顺利干掉它后回到神殿的1F取得瓦斯壶,把他交给里巴塞的道具店老板,第2天在去找他,得到飞空气球.
乘船去加登堡城东北方的小庙,在这里可以用小纪念章换装备,在小庙上边的洞穴中的B1处可以找到天空铠甲.然后,乘坐气球去多士镇东北方一个被山围住的沙漠中的世界树之村.设为三人战斗模式进入世界树,在5F见到一个叫路西亚的人,和他对话让他加入队伍,并在他后边的宝箱中拿得天空之剑.至此,四件天空的装备已经找齐了.乘坐气球去里巴塞上方的小岛,在岛上有个小庙和一座天空之塔,在小庙中可以得到男爵的角笛和光裙.
让勇者装备所以的天空装备,然后进入天空之塔,在而到达天空之城,到达天空之城后,路西亚会离队.自己则去找龙王对话,龙王会把天空之剑的力量提高.随后,在天空之城中找到路西亚,会得到小龙,随后,从天空之城的云层漏洞中跳下,进入一个洞穴,在洞穴的B6进到一个底下宫殿里面,从殿下宫殿的B6跳到B7中央的地板上,在旁边的宝箱中可找到锐之盾.
从底下宫殿的B9出来后,到达了一个地下世界,在旁边有个希望小庙.在希望小庙的上方是魔王城,因为被死亡比萨罗设下了结界,无法进入.先打败4个角的小BOSS,小BOSS被打败后,结界也会随着消失.接着设为最强队伍阵容进入魔王城.在魔王城中有个光珠,非常重要,别告诉我找不到啊!
穿过了魔王城,使用男爵的角笛,把其他的同伴唤过来,然后一起去上方洞穴找死亡比萨罗,单挑一定不是他的对手,群殴就不同了(生死关头那还在乎江湖道义),看他还死不死,不过他还真够强的,变身N次,但是还是逃不过勇者一行人的"千佛手",最终被杀的命运(邪始终不能胜正).
死亡比萨罗死后,洞穴开始崩塌,小龙在千钧一发之即飞出将众人救走,回到天空之城,龙王希望勇者能在天空之城,但最终勇者还是选择了回到地上世界,毕竟那里有曾经和自己一起战斗过的同伴和一起生活过的朋友,最重要的那是他的故乡.