重金属进入水生生态系统后，分布于水生生态系统的各个组分中，对生态系统各组分产生影响。当生物体内重金属积累到一定数量后，就会出现受害症状，生理受阻、发育停滞，甚至死亡，并使整个水生生态系统结构和功能受损、崩溃。

      对水生动物的危害  

      研究结果表明Cd对碱性磷酸酶的活性有明显抑制作用。重金属（Cd 等）对鱼大脑乙酰胆碱酯酶活性的影响。重金属进入水体后，可能会对水生动物的生长发育、生理代谢等过程产生一系列的影响。Cu、Zn、Pb、Cd 复合污染对鲫鱼DNA 合成有抑制作用。一定离子浓度的Zn、Pb、Cu、Cd 会影响鱼类胚胎发育并可能导致胚胎畸变。Ni 对淡水纤毛虫有急性毒性。Zn、Cu、Mn 的积累对鱼性别、身长有一定影响。海水重金属离子（Cu2+、Zn2+、Cr6+）含量超过一定浓度会引起文昌鱼中毒，使其身体渐成弯曲状而死亡。此外，有研究显示重金属对水生动物的遗传表达也会产生很大的影响。重金属（Cu、Zn）毒性对鲤鱼和罗非鱼金属硫蛋白基因表达的影响，罗非鱼暴露于重金属离子中，鳃和肝脏中金属硫蛋白mRNA 的表达受到显着影响。

      对水生植物的危害  

      藻类是水体的初级生产者，在水生生态系统的食物链中起着十分重要的作用。人们可以利用藻类及水生生物的敏感性来监控水体的重金属污染。众多研究表明，重金属对水生植物的生长能产生一定的毒害。研究发现重金属通过各种途径进入水体后，一旦被藻类吸收，将引起藻类生长代谢与生理功能紊乱，抑制光合作用，减少细胞色素导致细胞畸变、组织坏死，甚至使藻类中毒死亡，改变天然环境中藻类的种类组成。Cd 能破坏某些绿藻的叶绿素，引起光合作用下降，并对斜生栅藻和蛋白核小球藻呼吸作用产生影响，抑制苹果酸脱氢酶活性。一定浓度的Cd 能诱导硝酸还原酶活性，抑制超氧化物歧化酶活性，从而破环其抗氧化防御系统。

      对人体健康的危害

       重金属进入人体后，不易排泄，逐渐蓄积，对人体健康的危害是多方面、多层次的，其毒理作用主要表现在影响胎儿正常发育、造成生殖障碍、降低人体素质等。重金属（例如Pb、Se、Mn 等）通过水体直接或间接进入食物链后，能严重地耗尽体内贮存的Fe、维生素C 和其他必需的营养物质，导致免疫系统防御能力的下降，子宫内的胚胎生长停滞和其他一些残疾。重金属能抑制人体化学反应酶的活动，使细胞质中毒，从而伤害神经组织，还可导致直接的组织中毒，损害人体解毒功能的关键器官肝、肾等组织。目前的研究结果表明，Cr、Co、Ni、Cd、Se 等重金属元素均具有致癌、致畸、致突变等危险。