大多数错颌畸形可在恒牙替换完成时进行矫治，女孩一般在11-13岁左右，男孩一般在12-15岁左右。对可能会影响颌骨发育的错颌畸形（如反颌和口腔不良习惯）要进行早期治疗。乳牙反合一般在患者3-4岁时开始矫治，采用活动矫治器，通常3-6个月就可以矫正过来，但有一些患者在替牙期或恒牙早期会复发，需密切观察。对于严重的骨性错合畸形，则需要等到完全发育成熟后（约在18-20岁）进行正颌手术治疗，才能达到满意的疗效。