以前我们以为天和地一样大，结果到天上一看，地不过是天上的一个球。以前我们以为原子是小得不能再小的基本物质了，结果发现原子里还有电子。

这就好比是一个人站在一个很高很高的梯子上往下看，由于这个人只能看见云，便以为梯子是立在云上。云层低了一点，这个人便以为梯子长了一点，只有当云层彻底散去，这个人才会发现梯子原来最终是立在大地上的。

假设大自然从宏观到微观就是这么样一个梯子，那么物种便是是这个梯子中的一小节，而达尔文就是站在这个梯子上往下看的人。由于他看不见梯子下面的情况，所以便以为梯子是根据自然选择原理从他看得见的地方长出来的。

这是一种视觉范围内的局限性思维，这种思维方式的最大缺陷就是忽略了视觉范围外的宏观整体和微观结构。

现在，我们必须打破这种局限性的思维模式。如果将我们的思维朝着视觉范围之外的地方延伸出去便会发现，大自然就像是一颗层次性的高不见顶深不见底的参天大树。

在这颗大树上，宏观层次的树和微观层次的树是相互依存的。在星系这棵树上，他的根、茎、叶、花、果实和种子就是各类星球；在物种这颗树上，他的根、茎、叶、花、果实和种子就是物种体内的各类细胞；在生态这颗大树上，他的根、茎、叶、花、果实和种子就是生态环境中的各类物种；在物种DNA链这颗树上，他的根、茎、叶、花、果实和种子就是DNA链上的各类分子；而且各个层次上的各类树种都有一定数量的“种群”，往往是这颗树死了，另一颗树又诞生了。此外，如果宏观层次的树死了，相应微观层次的树也不可能生存。反之，特定的宏观树如果发芽，那就必然会长出的特定的微观树。

如果我们能理解这棵大树，那就所有的问题都容易理解了。下面，我就尽可能地用最简单、最通俗的语言来解释一些以往被人们认为是世界难题的问题。

1、宇宙是如何起源的？起源意味着从无到有，如果宇宙存在起源那就意味着宇宙是有限的。如果我们认为宇宙是无限的，那么宇宙就不可能存在起源的问题。此外，如果宇宙是有限的，那就必然存在终极微观。但是终极微观必然是没有结构的，而没有结构就不可能产生功能。如果终极微观是没有功能的，怎么可能产生不同性质的粒子、原子和分子？整个宇宙又怎么可能呈现出如此丰富多彩的局面？显然，这是极其荒谬的。因此，问题的答案是：宇宙是无限的，宇宙不存在起源的问题。

2、生命是如何起源的？人们通常所说的生命指的是生态环境中的物种。只要我们能真正地理解了物种与其相应的宏观层次和微观层次之间的关系便不难看出，生命的起源其实就像是一棵树长到一定时候会开花结果一样。只不过这棵大树是地球。

3为什么会出现寒武纪生命大爆发？一直以来，人们之所以会把这是一个问题当成一个迷来看待，是因为人们把达尔文的自然选择原理作为思考问题的前提了。进化论认为所有的物种都是同一个祖先（物种）的后代。根据这个逻辑，地球上最初的物种应该只有一个，然后同性繁殖为种群，又有种群变异为各类种群。但是，地球上何以会莫名其妙地出现一个物种？既然能出现一个又为何不能同时出现若干个？以前这个问题几乎被所有的人都忽略了。因为，以前几乎所有的人都以为生命是物质世界里偶然发生的奇迹，并把太多的精力放在了研究如何才能产生奇迹的问题上。现在，当我们有了生命起源的答案以后再来看这个问题，就像是树叶为什么会一下子从树上同时长出来一样简单。

4、物种为什么会发生变化？根据组合性结构理论，物种变化的原因只有两个，一个是随着无限宏观周期的变化而变化，这种变化是引发物种变异和导致物种生老病死的根源，虽然这种变化是规律性的但却是永远也不可能重复的；另一个是随着相应的宏观层次生长变化而变化的。这种变化会使物种看上去好像由简单到复杂、由低级到高级了，但这绝不是什么进化，而是像物种体内的细胞会随着物种的生长发育而逐渐地变得成熟一样。以往人们在观察物种变化的时候忽略了相应的宏观层次和微观层次的变化。

5、古今物种的演变过程为何会出现断层？根据达尔文自然选择原理的假设，物种的演变过程必须是一个遗传的过程，如果某个门类的物种灭绝了，那就再也不可能出现这个门类的物种了。但是，事实上地球上的物种已经经历了多次大灭绝了，迄今为止一个门类也不缺。对此，唯一的解释就是每次大灭绝总有一个幸存者。然而，即便如此也无法解释物种的演变过程为何会出现断层这个问题。

事实上物种的演变过程根本不是一个直系遗传的过程，如果某个门类的物种灭绝了，这个门类的物种照样还会出现。我们知道树上的树叶会随着四季的变化周而复始地生长，并且会随着树的生长而发生变化，比如说树叶越来越成熟，原来不开花后来开花了，原来不结果后来结果了。如果我们说生态也是一颗大树，那么，物种便是这颗大树上的根、茎、叶、花和果实。生态的冬天便是大冰期，每当大冰期来临，各类物种也会像树叶一样枯萎败落。但是当大冰期过去之后各类物种又会像树叶一样地萌发，而且随着生态这颗大树的生长，生态环境中的各类物种也会变化越来越成熟。也许人们在这个问题上最难以理解的是，人怎么可能从地里或者水里突然冒出来。关于这个问题只要了解一下人体胚胎发育的过程就不难理解了。只不过一个是在母体里十月怀胎，另一个是在自然环境下经过一段时间的演变，但是这个演变的过程绝不是进化的过程，而是胚胎发育的过程。因为，从一开始就已经决定了那是人，而不是猴子。这就是所谓断层的答案。

在以上解释中略去了所有学术上的论证部分，为的是让所有的人都能看得懂，但不知各位读者们对以上问题的通俗解释是否能够理解，如有不是之处敬请批评指正。