IIR 与FIR滤波器各有特点，可以由实际应用时的要求，从多方面考虑来加以选择。

1. 在相同的技术指标下, IIR滤波器由于存在着输出对输入的反馈，因而可用比 FIR滤波器较少的阶数来满足指标的要求，这样一来所用的存储单元少，运算次数少，较为经济。

2. FIR滤波器可得到严格的线性相位, 而IIR滤波器则做不到这一点，IIR滤波器选择性愈好, 则相位的非线性愈严重。

3. FIR滤波器主要采用非递归结构， 因而从理论上以及实际的有限精度的运算中, 都是稳定的。IIR滤波器必须采用递归的结构 , 极点必须在 z平面单位圆内, 才能稳定，这种结构，运算中的四舍五入处理, 有时会引起寄生振荡。

4. FIR滤波器，由于冲激响应是有限长的， 因而可以用快速傅里叶变换算法, 这样运算速度可以快得多，IIR滤波器则不能这样运算。

5. 从设计上看， IIR 滤波器可以利用模拟滤波器设计的现成的闭合公式，数据和表格，因而计算工作量较小，对计算工具要求不高。FIR滤波器则一般没有现成设计公式，窗函数法只给出窗函数的计算公式，但计算通带、阻带衰减仍无显示表达式。一般FIR滤波器设计只有计算机程序可资利用，因而要借助于计算机。

IIR滤波器主要是设计规范化的、频率特性为分段常数的 标准低通、高通、带通、带阻、全通滤波器，而FIR滤波器则要灵活得多，可以设计出理想正交变换器、理想微分器、线性调频器等 各种网络,适应性较广。