大唐王朝建立之后，秦琼官居护国公，他想起了当年自己的奶奶为自己许过的愿，所以他带着他的朋友以及相关的文武官员，回历城老家来还愿探亲。富贵还乡，场面极大。从长安带来的高僧们进行了大量的佛事活动后，用唐王李世民恩赐的御款重修庙宇，再塑金身。在庙前栽下了松树两棵，九塔寺东侧的松树是秦琼所栽（烟松），西侧的松树是尉迟恭所栽（茶松）。因九塔寺扩大了规模，并需要僧人们主持，所以跟随到此的高僧们都留在了此地，弘扬佛法，没再返回长安。

    一百多年后，此庙内的高僧在讲经说法的某一天看到了海市蜃楼中的天显宝塔，按其形建塔后，人们便把佛经中的故事照搬了过来，把所建之塔定名为“多宝塔”，把此塔以北的山定名为“灵鹫山”。

    从以上文字资料介绍，秦琼儿时这座山上就有座庙宇，但这个庙绝对不叫“九塔寺”，当时这座山也不叫“灵鹫山”，是一百多年后高僧讲法后按海市蜃楼中的式样建造了“多宝塔”，后改称为“九顶塔”。灵鹫山位于中印度摩羯陀国首都王舍城之东北侧，为释迦牟尼佛陀说法之地。故从此后这座山就改称为灵鹫山了。看来那座庙宇在隋初或者在隋朝之前就已存在，虽没有秦琼具体出生年代，从其在隋朝时已在军中为官效力向前倒推，秦琼儿时大约就是隋初或者之前出生。先有寺庙，到秦琼功成名就时还愿重修庙宇，栽植柏树，再后百年才修建了佛塔。由此推断佛塔的建造年代同专家考证不谋而合。