一般将Watson&Crick提出的双螺旋构型，称为B－DNA。B－DNA是DNA在生理状态下的构型，生活在细胞中的极大多数DNA以B－DNA形式存在。当外界环境条件发生变化时，DNA的构型也会发生变化。实际生活在细胞内的B－DNA的一个螺圈并不正好是10个核苷酸对，平均一般为10.4对。当DNA在高盐浓度条件下时，则以A－DNA形式存在。A－DNA是DNA的脱水构型，它也是右手螺旋，每个螺圈含有11个核苷酸对。A－DNA比较短而密，平均直径为23Å。大沟深而窄，小沟浅而宽。在活体内DNA并不以A构型存在；在细胞内的DNA－RNA或RNA－RNA双螺旋结构，却与A－DNA非常相似。现在还发现：某些DNA序列可以以左手螺旋的形式存在，称为Z－DNA。当某些DNA序列富含G－C且嘌呤和嘧啶交替出现时，可以形成Z－DNA。Z－DNA除左手螺旋外，其每个螺圈含有12个碱基对。分子直径为18Å，只有一个深沟。现在还不知道，Z－DNA在体内是否存在。