本发明公开了一种活性小分子阿胶的混合物及其制备方法和应用。本发明采用未加辅料的阿胶胶汁为酶解原料，并首次采用包括脯氨酸蛋白酶在内的复合蛋白酶对阿胶胶汁进行酶解，制得的产品纯度高，小肽含量高，游离氨基酸含量低(仅占4％)，分子量介于200-1000Da的小肽占比达81％，介于1000-3000Da的肽段占14％，重均分子量为765Da；对制得的原料的溶解性能、生物利用度和抗氧化功效进行了初步的测定，结果显示溶解性很好，生物利用度较普通阿胶提高2.5倍，对DPPH和ABTS自由基有接近100％的清除率。本发明对于具有千年历史的中药——阿胶的小分子肽类食品和保健食品的开发具有十分重要的意义。