菊科是被子植物第一大科，约有1600多个属、2.4万种植物。其中有许多大属，种类超过100种、甚至是1000种。不过，现在的一个趋势分子系统学的结果显示许多大属都不是单系类群，因此多被拆分为许多属，如千里光属Senecio、紫菀属Aster等。这些大属往往周边有很多小属，属的界限往往存在争议。因为属的种类太多，分类与系统发育研究都是个很大的挑战。

下表中标示红色的属表示属的界限还存在争议（当然仅局限于我了解到的），实际肯定不止这些。

资料来源：http://www.mobot.org/MOBOT/Research/APweb/welcome.html

共统计有83个包含50种及其以上种类的属，共包含种类约1.35-1.59万种，约占已知菊科总种类的60%。而菊科绝大多数的属种类不超过50种。无融合生殖的几个属，如山柳菊属、蒲公英属的种树差异极大，这也是分类及其困难与有争议的地方。

表格所列的大属可能有遗漏或有最近的修订，望指出。