数息观、不净观、慈悲观、缘起观、念佛观等，被称为五门禅。《五门禅经要用法》：“坐禅之要法有五门：一者安般，二不净，三慈心，四观缘，五念佛。”
禅是梵语禅那的略称，意译静虑或定，梵汉合称为禅定，即是止观不二或定慧不二的境界。《大乘义章》卷第十三解释说：“名別不同，略有七种：一名为禅，二名为定，三名三昧，四名正受，五名三摩提，六名奢摩他，七名解脱，亦名背舍。禅者是其中国之言，此翻名为思惟修习，亦云功德丛林。”
禅的种类繁多，远不止上述五门，具体见书末附表。
以打坐来修习禅定的方法，称为坐禅，简称打坐。释迦牟尼出家后，苦行六年，骨瘦如柴，受牧羊女供养乳糜，体力恢复后，端坐菩提树下思惟，是为佛教坐禅之始，释尊由此得悟成道。
然而，坐禅如果不得法，则会引发一些疾病。《释禅波罗蜜次第法门》卷四说：“夫坐禅之法，若能善用心者，则四百四病自然差（病愈）矣。若用心失所，则动四百四病。”《敕修百丈清规》卷五坐禅仪中也说：“坐禅乃安乐法门，而人多致疾者，盖不得其要。” 这些疾病，有生理方面的，如筋脉痉挛、呼吸不顺、头痛、手足无力、咳嗽等；有心理方面的，如精神失常、为鬼魅所著、幻听幻视等。这类因坐禅不得法而引起的疾病，被专称为禅病。其治疗方法，仍以禅法为主。
除乱法门
《治禅病秘要法》中，记载了多种治疗禅病的方法，现摘录如下：
（一）治乱倒心法（又名除乱法门、去恶声想）
病因及症状：因乱声发狂。
治疗方法：
1．服食酥蜜及阿梨勒。首先要用药物治疗，对禅修者而言这一点特别重要，所以放在第一位。参见“药石治病”一章。
2．系心一处。先想作一颇梨（玻璃）色镜。自观己身在彼镜中作诸狂事。见此事已，复当更观而作是言：汝于明镜，自见汝身作狂痴事，父母宗亲皆见汝作不祥之事。
3．举舌向腭，想二摩尼珠（如意宝珠）在两耳根中，如意珠端，犹如乳滴，滴滴之中，流出醍醐，润于耳根，使不受声。设有大声，如膏油润终不动摇。
4．次想一九重金刚盖，从如意珠王出，覆行者身。下有金刚华，行者坐上。有金刚山，四面周匝绕彼行者，其间密致静绝外声。一一山中，有七佛坐，为于行者说四念处（观身不净、观受是苦、观心无常、观法无我）。尔时寂然不闻外声。
治噎法
（八）治噎法
病因及症状：用心大急，数息太粗，眠卧单薄，因外风寒，因动脾管脾肾等脉，诸筋起风，逆气胸塞，节节流水，停住胸中，因成激血气发头痛背满诸筋挛缩。
治疗方法：
1．先服肥腻世间美药，然后仰眠，数息令定。
2．想阿耨达池（清凉池、无热恼池），其水盈满满一由旬，底有金沙四宝。金轮生黄金华，大如车轮。花中有四宝，兽头象鼻出水，师子口出水，马口出水，牛口出水，绕池七匝。
3．阿耨达龙王（八大龙王之一），七宝宫殿，在四兽（象、师、马、牛）头间。龙王顶上如意珠中，龙王力故，生一千五百杂色莲华。
4．青莲花五百，五百阿罗汉各坐其上。日暮则合，昼时则开。有七宝盖，在比丘上。有七宝床，在莲华下。
5．五百金色莲花，五百沙弥各坐其上。日暮则合，日昼则开。有七宝盖，在沙弥上。有七宝床，在莲华下。
6．五百红莲花，大菩萨眷属五百各坐其上。日暮则合，日昼则开。有七宝盖，在比丘上。有七宝床，在莲花下。
7．有七宝高台，长八千丈，从下方出，当阿耨达龙王宫前。有五百童子，在其台上，身真金色。
8．取阿耨达龙王所服白色庵婆陀药（味如甘蔗，形似藕根，味亦有似石蜜者）。服此药已，噎病得愈，四大调和，眼即明净。
智者大师的治疗经验
《天台智者大师禅门口诀》《摩诃止观》中记载的部分方法：
（一）    治身自作病者
病因及症状：坐时或倚壁或衣襟，大众未出而卧。此心懈怠，魔得其便，入身成病，使人身体背脊骨欲疼痛，名为注病难治。
治法：用息从头流气，向背脊历骨节边注下。
（二）    治坐不解调息成病
病因及症状：坐不解调息，令人身体枯闭而羸瘦。此人无罪易治。
治法：令息遍身，名遍息满息。以心住息，从头溜气遍满四肢，令以此二息从上流下，息遍满故，身即平复。可用止息，平心直住不动是名为止息。
（三）    治痢法
安心脐下，患冷痢则作暖息，患热则作冷息。
（四）    治嗽法
取嗽欲发时，三过吐气，然后安心中观。嗽欲发时便吐气令出，还如先安心自愈。
（五）    治肿法
作息肿断，令息撮聚欲遍。当肿上，以心住定，穿作一孔，令息从中出入。
（六）    治坐中忽得短气
可先嘘气，从鼻却入，令气满身竟令出。然后安心置掌文中，不久自去。
（七）治思劳
病因及症状：心少开悟于其深义，如有渐解，其心欢喜，思量过分，复得忍劳患，思劳之状众多，亦得头痛、气满。
治法：用息治之。行者当以智筹量，应止则止，应观则观，止观顺宜，便可得久。
治头痛法：鼻中入气，口中微引气出，意想念头中痛气，微从口出，若心细微缓调顺时，三度引气出，当自欠呿，如是引气欠呿不过至十，头痛则愈。
治腹中气满法：鼻中入气，口微引气出，意念腹中闷气，使从口中出，患时当嗌气，若腹中结极满患时，当仰眠申手脚，以手轻腹皮上，须按摩之十回、五回，当有嗌气，还复起坐，引气如前治法。若心调顺细，乃至十年二十年，结气满患，但一日一夜，心息调顺，气息调和，不缓不急，不粗不细，调和得所患皆愈也。若以息粗细缓急，调和不得所者，终不能愈也。若出息有声名“粗急”，出息如欲不续，名“细缓”，细缓者善。
又以腹中气满闷时，长引气出，更增其患，出息使不长不短，调顺和适，得所患必愈也。
注意：治头痛时，不得治腹满，治腹满时，不得治头痛，一时治两患，则更增其患。
坐禅入得好细心定，不得怀忧恚恼，必成气患，数入息时，数入息亦成气病缘，五脏中作境界，修定亦成病，乃至诵经，连文接句，或出气不时摄入，入气不时出尽成病，皆以前法治之。
又若头中气极，治其患时，鼻中入气而大开口，微引气出之。又勤坐之人，多喜有气。若有气患，常用口中出气治之。坐人齿冷，心得调细时，鼻中入气，还以鼻中，微引气出治之。其若心得调细，一切气患，尽用鼻出入息治之。
   （八）治心中浮乱或消沉
病因及症状：若修观过分，故心则浮乱；怡空过分，故心则沉。
治法：常善观察思惟治此患也。
   （九）治急挛病
病因及症状：坐禅人若调心在身中、五脏中，来缘境界，或谓五脏中，定心来缘境界，勤坐之人不久成病，能令行人，五脏界生气脉，与境界相连，使人得急挛病。
治法：意想观身中，上下使空，如木筒相。乃至临坐，及地皆令使空作意想，身中气息，尽使向下入地而去，若心调顺不久即愈。患若愈竟，教使观脚踝子上境界。又须教患者，汝得此患，由心错谬，谓言在身中。心法不在身外，不在身内，随所缘而生，汝当解之。
（十）治眼睛疼痛
病因及症状：坐人心念境界时，意谓作眼见相，又复坐人得住时，有光明照境界上，不知是心光明意光明，从明中出，住在境界上，是人不久患眼睛疼痛，令人眼闇痛。
治法：即以心缘眼，心见眼合，而作是念，见观之法，眼应开视，今见眼合，知非眼见。复次，缘眼时见境界上明，向上缘眼是心，心从明中出，而是心法不在内、不在外、不在中间，眼是心法故，随心所缘处生，亦复不在内、外、两中间。作是观时，错谬假心，患皆除断，眼患即除。
（十一）治腹胀患
病因及症状：若入深定，有大声触，声虽在外而在身中，声或在境界上声，是人欲出定，不能得出，心在身中怖怕，精神荒迷后乃得出，即令人得腹胀患；或暴下血有事触身得患，亦如是。
治法︰亦用调息，如前法也。若起嗔恚愤怒，则不可治。
（十二）治安般人举身卒痛
病因一：由食太饱未消，而便摄念，气粗念细，故使然也。
治法：二三日省食，节息令长，谛缘出息相，二三日坐便愈。
病因二：由摄念太急，则气结故病。
治法：想身状甑（炊器）上饭气，然后想有风，从脐中起，出至面门，面门者口也，转转猛大，吹身气令散，散后身痛即愈。数日须食肥腻，食慎勿见风。又治法于未食时，密室中慎勿闻声，宽放四肢，于面门调和气息五过，二三日坐即愈。
（十三）治八触相违病
病因及症状：若发八触用息违触成病。八触者，心与四大合，则有四正体触，复有四依，触合成八触。重如沉下，轻如上升。冷如冰室，热如火舍。涩如挽逆，滑如磨脂。软如无骨，粗如糠肌。此八触四上四下，入息顺地大而重，出息顺风大而轻；又入息顺水大而冷，出息顺火大而热；又入息顺地大而涩，出息顺风大而滑；又入息顺水大而软，出息顺火大而粗。若发重触而数出息，与触相违即便成病。余例可知。
治法：若因重触，成地大病，偏用出息治之。若发轻触，成风病，偏用入息治之。若发冷触，成水病，偏用出息治之。若发热触，成火病，偏用入息治之。余亦如是！若得调和正等，随意而用；此用常所数息，非作别息也。