到了清朝，瑷珲已成为为当时黑龙江沿岸最大的城镇。瑷珲城人杰地灵，先后出过9位将军。9位将军的石碑就竖在城南的松林里。

1900年8月3日，沙俄侵略军从南、北、东三面夹攻瑷珲城，城池失陷。沙俄侵略者将这座200多年历史的古城，付之一炬，幸存的只有一座魁星阁。

瑷珲魁星阁大约建于清朝光绪十八至二十六年间，即公元1892年——1900年。魁星阁历来就是人们登高远望的最佳去处。登上阁顶，极目远眺，古城全貌、十里大江尽收眼底。然而，当看到江东大片沃土已不属于中华民族时，人们的心情可想而知。   

魁星阁是中华民族珍贵的文化古迹，它不仅目睹了中华民族耻辱的一页，也记载了我国军民可歌可泣的英雄事迹。

1980年开始复建魁星阁， 7月，复建工程正式动工。1983年为落成的魁星阁举行典礼仪式。原黑龙江省省长陈雷为魁星阁题写了“魁星阁”三字匾额。

复建后的魁星阁高16米，底边各为8米。建筑古朴浑厚，气势宏伟。