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最完整的塔迄今为止斯马尼亚虎基因组,由110年历史的盐泽头拼凑而成

(2024-10-29 10:30:22)

撰文:萨沙.佩里                     20241017

一只 108 岁的塔斯马尼亚虎头骨,皮肤碎片仍附着在体外。这不是本文中提到的样本。(图片:Colossal Biosciences

科学家们从一个有百年历史的盐泽头中.组装了迄今为止最完整的塔斯马尼亚虎基因组,提供了完整的 DNA 蓝图,有可能使这个已灭绝的物种恢复生机。

这一突破是由 Colossal Biosciences 公司牵头的、塔斯马尼亚老虎灭绝工作的几项新进展之一,这要归功于一个 110 年前的老虎头,该头被剥皮并保存在乙醇中。该标本的特殊保存使研究人员能够拼凑出其大部分 DNA 序列,以及 RNA 链(一种结构与 DNA 相似但只有一条链的分子),这条链显示了动物死亡时,哪些基因在各种组织中活跃。

到目前为止,许多专家认为不可能从历史样本中重建完整的基因组,澳大利亚墨尔本大学遗传学和发育生物学教授安德鲁·帕斯克说,他的团队帮助组装了塔斯马尼亚虎的基因组。事实证明,“你绝对可以从旧样本中获得一个惊人的基因组,”他在一封电子邮件中告诉《生活科学》。

塔斯马尼亚虎或袋狼,是肉食性有袋动物。经数十年人类迫害后,于 1936 年灭绝。帕斯克说,袋狼是顶级捕食者,在塔斯马尼亚的生态系统中发挥着“绝对关键的作用”。有空间重新引入该物种,并且世界各地的博物馆收藏和研究中心都有保存完好的标本,这意味着该物种可以实现不灭绝。

相关新闻: 科学家声称,早已灭绝的塔斯马尼亚虎可能还活着并在荒野中徘徊

   基因组为未灭绝物种供了完整的蓝图,因此拥有它的完整和非常高质量,对这些工作有很大帮助,”Colossal 科学顾问委员会成员帕斯克说。

新组装的基因组大小与人类基因组相似,由 30 亿个碱基对核苷酸组成,这些核苷酸是形成 DNA 梯级的分子。根据 Colossal 与《生活科学》 分享的一份声明,DNA 序列中仍然存在 45 个空白,科学家们希望在未来几个月内,通过进一步测序来填补这些空白。

在盐泽的头部中发现的 RNA 片段,将使研究人员能够检测袋狼存活时在不同组织中开启的基因,帮助他们确定动物可以尝到、闻到和看到什么,以及它的大脑是如何运作的。与 DNA 相比,RNA 的稳定性要差得多,并且随着时间的推移更容易受损,因此它的保存“可以帮助我们以一种我们从未想过的方式了解袋狼的生物学特性,”帕斯克说。

Colossal 宣布了其袋狼未灭绝项目的另一项突破,该项目可用于保护生物物种。一个致力于辅助生殖技术 (ART) 的研究小组,发现了一种肥尾袋鼠中触发排卵的方法,肥尾袋鼠是一种小型的老鼠状有袋动物,是袋狼最近的现存亲戚。声明称,肥尾袋鼠的排卵会同时产生许多卵子,一旦完成,研究人员将把袋狼基因组注射到这些卵子中。该公司表示,它还将使用肥尾袋鼠作为代孕点来培养袋狼胚胎。

该团队还在研究一种人工子宫装置来培养有袋动物胚胎。该设备现在从怀孕开始到怀孕中期都可以寄存胚胎,这在世界上尚属首创。

“它们都是巨大的突破,” 帕斯克说。“有袋动物 ART 的发展对濒危有袋动物的圈养繁殖具有重大影响——但也为濒危有袋动物的养育奠定了基础。

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