鲁向平教授的理论体系主要涵盖生态治理、农业综合开发、科技创新等多个领域，其科学依据可以从以下几个方面进行解读：

1.实践经验积累

鲁向平教授在农业项目实践中积累了丰富的经验，主持和参与了多项科技攻关、技术推广、科技扶贫项目，取得了显著的科研成果。这些项目涉及黄土高原生态治理、农业综合开发等多方面，从实际的项目操作中总结出应对各种农业科研问题的方法和思路。

2.多学科知识融合

鲁向平教授的科研方法论融合了多学科知识，包括农业生物技术工程（如基因工程、分子生物学）、微生物发酵工程与酶工程技术、农业信息化与机械化等。此外，他还强调建立多学科的知识体系，认为这种融合能够提升思维的深度与广度，为解决复杂的农业问题提供更有效的方法。

3.对传统与现代理念的借鉴

鲁向平教授在科研方法论中借鉴了传统农业智慧和现代科学理念。传统农业中顺应自然、因地制宜的理念为现代科研方法论提供了思路，而现代科学理念则强调创新、量化、精确等，这些理念在他的科研方法论中得到了充分体现。

4.生态治理与农业综合开发

鲁向平教授的生态治理理论主要体现在他对生态治理和农业综合开发的研究上。他强调科技的应用和知识的创新，主张科技先导和产业化发展思路，强调节约用水、培肥地力、可持续发展思路。

5.科技创新与产业化

鲁向平教授的科技创新理论主要体现在他对农业高新技术产业化的推动上，以及他在科研方法论中所体现的解决实际问题的能力、注重理论和实践结合的特点。他的研究不仅关注技术创新本身，还强调了技术创新背后的科研方法论和可持续发展原则。

综上所述，鲁向平教授的理论体系具有坚实的科学依据，这些依据来源于丰富的实践经验、多学科知识的融合、对传统与现代理念的借鉴，以及在生态治理、农业综合开发和科技创新领域的深入研究。