2003-2004赛季

2003年1月9日火箭对魔术，姚明被对手抓伤背部

2003年3月27日，火箭主场迎战湖人。在第三节比赛中，姚明在跟福克斯争抢篮板时被对方顶到下巴，顿时倒地血溅球场；2005年9月14日，男篮亚锦赛中国队对阵黎巴嫩队，比赛第二节，黎巴嫩队球员在上篮时将姚明撞倒，但裁判并没有吹犯规。倒在地上的姚明爬起来后，觉得下巴有些异样，用左手一抹，竟然被撞出了血；2005年4月4日，火箭主场迎战太阳，第四节姚明在防守中下巴遭到了对方球员的肘击。赛后，姚明的下巴第一次挨了两针。

2004年6月底，姚明在达拉斯参加中国男篮的对抗训练时，右脚大脚趾被踩伤。紧接着在7月1日，他的大脚趾甲不幸又被踩翻了半个，痛得他嘴里不住地抽冷气。男篮主教练哈里斯次日请当地医生为姚明治疗，医生为他引出了剩余趾甲里的瘀血。但之后的检查效果并不理想，受伤的脚趾甲已经坏死。7月3日，医生实施摘除手术，把姚明几乎全部坏死的大脚趾甲拔掉

2004年10月28日 在火箭和马刺的季前赛中，姚明在和内斯特洛维奇在抢位过程中弄伤手臂，姚明因此缺席缺席火箭最后一场季前赛。之后的一个多月的比赛中，姚明都要带着一个一公斤多重的黑色护肘进行比赛。

2005-2006赛季

2005年3月31日火箭对开拓者，姚明被河升镇撞伤膝盖

2005年12月7日 火箭主场迎战凯尔特人，姚明在篮下抢位过程中被凯尔特人中锋斯卡拉布赖恩一肘击中眉骨，姚明轰然倒地，痛苦地用手捂住眼睛，手拿开时，右眼眉骨已是鲜血淋漓，他马上在训练师的搀扶下走入更衣室。可惜裁判竟然判罚姚明阻挡犯规，丰田中心里顿时响起一片嘘声。姚明事后缝了9针，此次受伤没有造成姚明停赛；在2000-01赛季CBA的总决赛上海和八一的比赛中，姚明在比赛中和队友乔治相撞，左眉骨受伤。虽然姚明缠着绷带继续比赛，但是依然最终无缘总冠军，而在2003年的国家队集训中，姚明在训练中和队友王博相撞，左眉骨破裂，缝了8针。

2005年12月9日，火箭客场挑战国王队，比赛进行到第四节，火箭大比分领先，姚明持球进攻，米勒恼羞成怒，对着姚明迎面就是一掌，当时姚明捂着脸呈痛苦状，等他松开手后，脸和鼻子上已经赫然留下几道疤痕。本次受伤只影响姚明观感，并没有造成实质伤害。
 
2005年11月27日火箭对公牛，姚明脚踝扭伤

 
2005年12月7日火箭对凯尔特人，姚明眼角受伤下场

 
2006年12月24日，火箭主场对阵快船，姚明因为右膝下方的骨头出现骨折的迹象，需要至少休息六周的时间，在休斯敦火箭今天与洛杉矶快船的比赛第一节，姚明跳起想封盖快船球员的投篮，落地时，右膝下方连续遭到海耶斯以及蒂姆.托马斯的撞击，姚明的膝盖甚至还被托马斯的身体压了一下，倒地后，姚明马上捂着自己的膝盖，表情极为痛苦。后经核磁共振检查确定为右腿胫骨的非转移性骨折（骨头没有断开）。

2007-2008赛季

2007年3月19日火箭对马刺，姚明受伤倒地

 
2007年4月10日火箭对国王，姚明再度受伤

 
2008年2月26日，姚明左脚脚踝终于不堪负荷，被检查出应力性骨折，宣布赛季报销。

 
2008年10月10日火箭对灰熊，姚明中指受伤

 
2008年11月26日火箭对步行者，姚明眉骨受伤

 
2009年1月24日火箭对步行者，姚明的膝盖感到疼痛，下半场离场

 
2009年2月9日火箭对森林狼，杰佛逊撞伤姚明左肩

 
2009年2月26日火箭对开拓者，姚明眉骨受伤

 
2009年季后赛第二轮火箭对湖人，姚明和科比膝盖相撞倒地不起

2009年5月9日，姚明在季后赛第二轮与湖人的第三场比赛中因左踝受伤离场，赛后接受了CT检查，证实为左脚骨裂，将缺席季后赛剩余部分。