区域经济合作实质是科学发展观在区域经济上的体现。自从科学发展观提出后，区域经济越来越重要，在区域经济社会发展的基础上提上了各个省市发展的日程。北京编制“十一五”规划时提出功能核心区、城市功能拓展区、城市发展新区和生态涵养发展区四个功能分区，对各个区域确定了功能定位，避免各区县之间的同质竞争。汪洋在重庆做了“一小时都市圈”，国务院将其作为全国统筹城乡综合配套改革试验区。关于都市圈目前几乎各个省都在做，已正式提出建设都市圈的城市和地区有近20个。

    但是，目前几乎每个区域都是在摸黑探索区域经济合作。实际上区域经济合作是有其内在规律的，核心问题体现在三个方面：

    一是都市圈、城市群的协作发展。当区域经济发展达到较高水平、城市化水平较高时，就会形成城市群、都市圈。美国大约是20世纪二十年代，开始出现真正意义上城市群、都市圈，当时的美国城市化水平大约达到47%，人均GDP近5000美元。同时，城市群、都市圈的形成还是一个城市化的过程。目前我国经济发展也开始进入这个阶段。都市经济圈在其发展初期，核心城市通过极化效应集中了大量的产业、自然资源和人力资源等，自身获得快速的发展，而此时核心城市的扩散效应并不明显，城市周边区域的发展受到抑制。必须建立长效的区域经济协作发展机制，促进区域之间的市场对接、产业转移和配套、产业融合，形成区域城市之间协作发展的局面。

    二是城乡经济一体化。比如北京最大的问题是“灯下黑”，其中最大问题是城乡差异在拉大，而不是

缩小，城市边缘地区很难分享中心城市的发展成果，这实际上反映出城乡合作的缺乏。2005年的统计显示，河北与京津接壤的六个设区市中，贫困村庄有3798个，贫困县则有32个，占该地区县(区)总数的44%。要破解环京津贫困带发展落后的困局，必须加强城乡合作，逐步改变对城乡的二元宏观政策，实现城乡平等的一体化宏观管理。构建区域“共赢”发展机制。

    三是行政区划和经济区划的关系越来越难以处理。20世纪下半叶，日本GDP则主要产出于大东京区、坂神区、名古屋区，这三大组团式城市群对日本的经济整体贡献率超过70%。就中国而言，珠江三角洲的GDP目前约占全国的10%，长江三角洲京津唐环渤海湾地区这三大组团式城市群对中国的经济整体贡献率仅达35%。造成这种差距的最关键一点在于中国的行政区划和经济区划是相互矛盾的。