综合分析和鉴定m6ARNA甲基化调节因子对前列腺癌进展及预后的影响
(2023-11-28 09:59:36)
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综合分析和鉴定m6A
RNA甲基化调节因子对前列腺癌进展及预后的影响
张乐1宁静华1张鑫1王振1刘虹汝1张钰哲1,2,3
1.
大理大学基础医学院病理学与病理生理学教研室2. 云南抗病原药用植物筛选重点实验室3.
云南省昆虫生物医药重点实验室
摘要:
目的
基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,应用生物信息学方法分析N6-甲基腺苷(m6A)
RNA甲基化调节因子(以下简称m6A调节因子)在前列腺癌进展过程中的分子特征及临床意义。
方法
基于13种m6A调节因子对前列腺癌数据进行分析,以识别不同亚群,并进行差异表达分析。基于差异基因构建LASSO
Cox回归模型,并绘制Kaplan-Meier生存曲线和受试者操作特征曲线,计算曲线下面积,以判断模型预测性能。对关键因子进行免疫浸润分析。
结果
基于13种m6A调节因子识别出与前列腺癌发生密切相关的亚群。获得由6种m6A调节因子(OAS3、MYOF、SMIM22、SNORD60、ROMO1、MRPL41)构建的风险模型。ROMO1在前列腺癌中表达水平较高,并与CD8+T细胞的免疫浸润相关性强。
结论
m6A调节因子的表达与前列腺癌的临床病理特征高度相关。ROMO1在前列腺癌中高表达,有望作为独立预测前列腺癌预后的生物标志物,为基于m
RNA的表观遗传修饰角度理解和探索前列腺癌的早期诊断和临床治疗提供了线索。