1.切除修复

（1）碱基切除修复

碱基切除修复主要修复单个碱基损伤。指在一系列酶作用下，将DNA分子中损伤的部位切除，以相应未损伤的另一条链作为模板，合成新链并填补切去的部分，之后将其连接起来的过程。

碱基的切除修复是DNA维持稳定的重要方式。包括3步反应：①由细胞内特异的酶识别损伤部位，水解苷键，切除该碱基；②DNA聚合酶合成新链；③连接酶连接。

（2）核苷酸片段切除修复

DNA螺旋结构有较大损伤变形时，则以核苷酸片段切除修复方式进行修复。常见的是短片段切除修复方式进行修复。常见的是短片段修复。损伤链由切除酶。该酶也是一种内切核酸酶。但在链的损伤部位两侧同时切开，与一般的内切核酸酶不同。编码此酶的基因是uvr基因，由多个亚基组成。

切除酶可以识别消除多种DNA损伤，包括紫外线引起的嘧啶二聚体和其他光反应产物，消除补骨脂素衍生物和嘧啶加合物。

细胞内有多种特异性的DNA糖苷酶，能识别DNA中不正常的碱基，并将其水解脱落。

2.错位修复

DNA在复制过程中发生错配，如果新合成链被校正，基因编码信息可得到恢复；但如果模板链被校正，突变就是被固定。细胞错配修复系统能够区分“旧链”或“新链”。Dam甲基化酶可使DNA的GATC序列中腺嘌呤N6位甲基化的链切除，并以甲基化的链为模板进行修复。即DNA的半甲基化可区别子链与母链，使子链中的错配碱基被切除修复机制去除。

3.直接修复

1）光复活作用  紫外线照射损伤是同一条DNA链的两条相邻嘧啶之间以共价键链接而成的环丁烷嘧啶二聚体结构。这种结构影响能阻碍复制和转录的信息传递过程。

光复活作用是高度专一的直接修复方式。E.coli的光复活酶含2个色素分子，Nf,N10 一次甲基四氢叶酸和还原性的黄素嘌呤二核苷酸。酶分子通过生色基因吸收蓝色或接近UV波长的射线，再把能量转移到待切环丁烷中的辅因子。被激活的FADH通过电子转移引发环丁烷嘧啶二聚体裂解，酶同时脱落。

（2）O⁶-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶（MGMT）直接修复

O⁶-甲基鸟嘌呤是被烷基化了的碱基，它以改变了碱基配对的性质。这种损伤可在MGMT作用下，将甲基转移到酶自身的半胱氨酸残基上，从而得以修复。

（3）单链断裂修复

修复这类损伤时用过重接，只需要DNA链接酶参与，属于直接修复。

4.重组修复

切除修复一般发生在下一轮DNA修复之前，又称复制前修复。机体细胞对在复制起始时尚未修复的DNA损伤部位可先复制再修复，这种方式称为重组修复。

参与重组修复的酶系统包括与重组和修复两个过程有关酶类。

5.易错修复和SOS反应

许多造成DNA损伤或抑制DNA复制过程，能引起一系列复杂的诱导效应，这种效应称为应激反应（SOS）。SOS反应包括诱导DNA损伤修复、诱变效应、细胞分裂的抑制以及溶源性噬菌体等。

SOS反应诱导的修复体系包括：避免差错修复和易产生差错修复，其中的错配修复、直接修复、切除修复和重组修复能够识别DNA损伤的部位或错配碱基二加以清除，在这些修复过程中不引人错误碱基，属于免差错的修复，SOS反应能又到切除修复中某些关键酶和蛋白质的产生，使这些酶和蛋白质在细胞内的含量升高，从而产生缺乏校对功能的DNA聚合酶，使之在DNA链的损伤部位即使出现不配对碱基，复制也能继续进行，以保证细胞的存活。但在这过程也带来了高突变率。

SOS反应广泛存在于原核和真核生物，它是生物体在不利环境中求得生存的一种基本功能。它主要包括：①DNA的修复；②导致变异。