加载中…[转载]怎么利用DAVID做富集分析
(2017-11-16 00:27:21)
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分类： 生物信息学 |
原文地址：怎么利用DAVID做富集分析作者：-爱小果冻-
DAVID对基因做富集分析
作为一只生信狗，基于很多算法去找到一些显著基因后，接下来想去看这些基因都影响了哪些功能，常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析了，在临近毕业这段时间，发现很多小伙伴居然忘了怎么用DAVID来做富集，当然，我也是其中一员[捂脸]，所以就想说，我应该把这个具体操作记录下来，让大家以后即使忘了，看见我的这个总结也可以很快上手。
- （1）首先进入DAVID主页（网址：https://david.ncifcrf.gov/）
- （2）选择“Functional Annotation”,利用它完成基因的功能注释和通路富集分析。（要记得选物种信息，要不然出来的结果就是该基因集合在DAVID里面所有物种的注释结果哦！）
- （3）这时，我们就可以输入我们感兴趣的基因集合，具体参数设置如下图
- （4）结果出来了。但我们具体去看哪部分的结果呢，这也是个问题！嘻嘻，所以，接着往下看吧!
以上就是，我做的总结！对了，要注意的一点是，单个基因不能注释到通路哦！反正在毕设这段时间，自己做富集的时候，发现其实DAVID不是很好用，如果对于单个基因的注释，我是在UniGene和GeneFinder上去整的！看个人结果吧，如果你需要用到DAVID，我觉得我这个攻略其实挺详尽的了，希望对你们有用！
因为发现DAVID还可以做miRNA的通路富集，研究了下，在下一篇博客中再和大家一起分享吧！
分享即快乐，自己还只是生物信息入门，大家有啥问题可以继续探讨！
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