R分为R1和R2，又各分为R1a,R1b, R2a,R2b.其中R1a分布在东欧、中东、中亚、南亚，以及中国国内有白人血统的人群中；R1b分布在西欧。因为R基因的分布范围与印欧语系高度重合，不少人认为R是印欧人的标志基因。

每个单倍群下都有好多个分支，一般以二叉分支为主，有些时候国王生育好多儿子，儿子又都生育好多子孙的话，在几代内会出现许多个变异类型，就会有星状或簇状分支。对于R1a来说，其最古老的根部的基因型，却是比较少见的。根据Underhill的数据，在16244名欧亚大陆的男性（不包含中国）中，共有2923名R1a，但是其中R1a*只有24人，R1a1*只有6人，R1a1a1*只有12人。R1a*的24人中有18人在伊朗，3人在土耳其，另外阿曼、阿联酋和意大利（可能是移民）各一人。由于这些根部基因型主要出现在伊朗，有理由认为伊朗或附近区域是印欧人的起源地。

目前已知的R1a*的分布位置并不太广泛，而且在从伊朗到中国之间的地区都没有出现，因此应该不存在那种成规模迁徙到中国定居的现象，而更有可能是当年的波斯商人通过陆路或海路到中国经商，而后在中国定居下来。最有可能的陆路就是途径伊朗的丝绸之路。

对于中国现存保留有部分白人基因的人群，不少人以为经过长时间的与中国本土蒙古人种的混血，白人基因已经可以忽略不计了。但实际上如果考虑到有些地方有比较稳定的西欧亚人群社区，白人基因还是能够留存一定年代的。比如回族有一个规定叫内娶不外嫁，也就是可以娶汉族媳妇，但是自己的女儿只能嫁给回族人。假设一群波斯商人男性来到中国，全部娶了当地女子为妻，那么他们的孩子都是拥有50%的白人基因。如果这个社区足够大，有几十户人，那么他们的孩子应该也至少有几十人，而且性别比例接近1：1。这样的话他们如果在族群内通婚，不引入新的汉族基因，那么在好几代人之后，他们的后代仍然平均拥有50%的白人基因，在面相上仍能看出与汉族不小的差异。

另外需要注意不是所有的R基因中国人乃至有西欧亚血统的中国人都有伊斯兰的祖先。中国人中混入白人基因的过程很复杂，比如中亚的一些民族从来就没有信仰过伊斯兰教，他们有些迁徙到内地，融入了汉族，比如唐五代时的粟特人。