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[转载]【学习】microRNA主要通过诱导目标mRNA的降解来调控基因表达

(2018-04-24 15:58:21)
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    MicroRNA为一类转录后水平的调控因子,即不直接作用于基因而是通过作用于基因转录出的信使RNA(mRNA)来下调目的基因的表达。偶联了蛋白复合体的microRNA能够通过两种机制中的一种行使功能:mRNA的切割或翻译抑制。一般认为,如果microRNA与mRNA的3’端非编码区(3′UTR,与mRNA的稳定性、亚细胞定位和翻译水平有关)具有完美的互补性,microRNA就指导mRNA特异性切割,即使mRNA降解;如果两者没有足够的互补性,则miRNA就指导翻译抑制,即只影响蛋白表达水平,不影响mRNA的稳定性。最先发现的lin-4let-7都被认为是通过后一种方式发挥作用的。但越来越多的人开始质疑后者的普遍性,认为mRNA降解速度的提高必然也会带来蛋白表达水平的下降,便难以区分到底是哪种机制起决定性作用。怎样才能巧妙地将蛋白质与mRNA之间的依赖关系理清,进而确定此两种机制在microRNA下调基因表达的过程中的相对贡献呢?

2010年8月Nature上,David Bartel及其同事创造性地将核糖体图谱分析技术(ribosome profiling,见Box.1)运用于此问题的研究,得到了意想不到的结果。相比较蛋白质组学,核糖体图谱分析具有可与mRNA图谱分析相媲美的时效性。利用这个新颖的工具,Bartel发现microRNA主要通过使目标mRNA被降解来发挥作用(84%以上的的蛋白水平下降由这一作用造成),而不是通过抑制它们的翻译。这个突破性的研究结果预示着很多以前关于microRNA作用机制的结论将面临重新评估。

http://s1/middle/4fd1747en9eb8b45bf4a0&690

 

Box.1 核糖体图谱分析(Ribosome profiling

    核糖体图谱分析是2009年才由Jonathan Weissman等建立起来的一项生物技术,将其与深度测序(deep sequencing)相结合,研究人员可以从基因组水平监测蛋白质的翻译状况。Bartel等先用环己酰亚胺处理细胞使核糖体较易结合在对应的mRNA上,接下来对细胞进行核酸酶处理时,没有被核糖体保护的mRNA片段将被水解,而被保护的部分将留下。再用一定方法将这些片段从核糖体内释放,进行深度测序,就能获取有关翻译的信息,从而更准确地预测蛋白质的丰度。将所得结果与同样条件下获取的mRNA图谱进行对照,即可知道蛋白含量与mRNA量的关系。

 

ORIGINAL RESEARCH PAPERS

Guo, H., Ingolia, N. T., Weissman, J. S. & Bartel, D. P. Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels. Nature 466, 835-841 (2010). Article

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