华亭寺始建于大理国时期，为大理国鄯阐匡国侯高智昇的宅院。元玄通元峰禅师创建大光明殿、供毗卢佛和圆觉十二大士，寺称圆觉寺。明朝正统六年（1441年）明英宗赐名华亭寺。1923年，虚云法师重修华亭寺，又名“靖国云栖禅寺”。虚云老和尚的弟子具行和尚用自己身上发出三昧真火把自己烧掉了的事迹就在华亭寺，他当时念佛的木鱼、经架、僧鞋、衣服乃至自己的肉身全部烧成灰了。虽然肉身已经烧成灰了，但是还是像活人一样坐在那里，而且香气扑鼻。